More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0119 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0119  peptidase, M16 family  100 
 
 		 459 aa  932    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0068  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  94.3 
 
 		 458 aa  855    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0035  peptidase M16-like  67.51 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0462625  normal  0.189668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0160  peptidase M16 domain-containing protein  60.61 
 
 		 468 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0162  peptidase M16 domain-containing protein  60.61 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5083  peptidase M16 domain-containing protein  61.45 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0317746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0144  insulinase family metalloprotease  60.18 
 
 		 468 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237598  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72250  putative metalloprotease  52.86 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6271  putative metalloprotease  52.14 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  25.99 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  24.58 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  25.46 
 
 		 477 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.69 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 		 878 aa  87  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  23.23 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  29.02 
 
 		 840 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  29.6 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  29.6 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  24.8 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  25.9 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  24.02 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  24.66 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  28.3 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  24.24 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  25.9 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  25.27 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1699  M16 family peptidase  25.07 
 
 		 872 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  28.03 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  28.63 
 
 		 924 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  28.36 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  24.57 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  21.41 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  27.4 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  25.28 
 
 		 940 aa  73.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  27.85 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  28.92 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  20.29 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  28.92 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  26.09 
 
 		 927 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  25.26 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  22.51 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  25.54 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  29.2 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  29.44 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  24.63 
 
 		 937 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  28.63 
 
 		 928 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.06 
 
 		 896 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  26.34 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  26.7 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  26.67 
 
 		 853 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1343  peptidase M16 domain-containing protein  27.27 
 
 		 951 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.690972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  23.31 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  27.69 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  19.94 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  26.88 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  24.6 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  29.13 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  23.77 
 
 		 868 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  28.4 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  19.02 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  25.98 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  28.29 
 
 		 919 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  21.1 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  20.15 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  22.59 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  22.59 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  22.86 
 
 		 494 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  28.16 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  26.24 
 
 		 514 aa  67  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.27 
 
 		 450 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  27.62 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  27.62 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  21.57 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  27.11 
 
 		 937 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  20.58 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.27 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  27.95 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  23.84 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  20.79 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  26.3 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  24.65 
 
 		 429 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  24.65 
 
 		 429 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  25.74 
 
 		 925 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  22.86 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  24.65 
 
 		 429 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  20.29 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  27.71 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  20.29 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  20.29 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  20.29 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  20.29 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  22.54 
 
 		 912 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  25.86 
 
 		 943 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  20.29 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  25.26 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  26.45 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  20.29 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  26.5 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>