More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6271 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6271  putative metalloprotease  100 
 
 
457 aa  920    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72250  putative metalloprotease  95.49 
 
 
457 aa  829    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5083  peptidase M16 domain-containing protein  52.38 
 
 
468 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0317746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0119  peptidase, M16 family  51.24 
 
 
459 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0144  insulinase family metalloprotease  52.11 
 
 
468 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237598  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0162  peptidase M16 domain-containing protein  51.66 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0160  peptidase M16 domain-containing protein  52.11 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0068  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  50.55 
 
 
458 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0035  peptidase M16-like  52.05 
 
 
463 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0462625  normal  0.189668 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  25.83 
 
 
484 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  25.59 
 
 
484 aa  87.8  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  20.88 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  26.18 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  24.14 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  26.02 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  24.64 
 
 
937 aa  80.1  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  29.72 
 
 
878 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  25.7 
 
 
492 aa  79.7  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  20.31 
 
 
454 aa  79.7  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  19.46 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  20.99 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  27.45 
 
 
415 aa  77  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  26.67 
 
 
840 aa  77  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0396  peptidase, M16 family  26.75 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  26.65 
 
 
514 aa  76.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  25.11 
 
 
912 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0560  peptidase M16 domain protein  26.75 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.46 
 
 
506 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  29.07 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  31.48 
 
 
853 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  18.87 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  19.22 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  24.14 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  24.4 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  24.71 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  23.25 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  24.4 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  24.4 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  18.63 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  27.11 
 
 
493 aa  73.2  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  27.04 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  29.04 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  24.67 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  18.63 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  25.44 
 
 
441 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  18.63 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  29.41 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  22.79 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  18.63 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  18.63 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  18.63 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  18.63 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  18.63 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  24.68 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  24.14 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  24.34 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  23.51 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  24.68 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  23.88 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  19.43 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  23.51 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  19.14 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  25.14 
 
 
896 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  23.09 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  23 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  25.64 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  24.57 
 
 
928 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  22.89 
 
 
494 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  20.35 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  22.62 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  22.44 
 
 
919 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  22.77 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  23.42 
 
 
504 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  22.62 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  23.62 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  22.97 
 
 
453 aa  67  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  26.62 
 
 
509 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  24.79 
 
 
530 aa  67  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0931  peptidase M16 domain protein  18.79 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  19.07 
 
 
399 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  19.95 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  28.63 
 
 
433 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  22.47 
 
 
424 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  25.31 
 
 
459 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1613  peptidase M16 domain-containing protein  18.93 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  21.01 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  22.43 
 
 
501 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0576  peptidase M16-like  27.04 
 
 
473 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  26.79 
 
 
937 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  24.4 
 
 
954 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  23.15 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  21.52 
 
 
414 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0393  peptidase M16 domain-containing protein  21.87 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  21.66 
 
 
461 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  23.11 
 
 
443 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  27.29 
 
 
470 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0570  peptidase M16 domain-containing protein  18.38 
 
 
409 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0842  peptidase M16 domain-containing protein  25.18 
 
 
471 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.060004  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.9 
 
 
452 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  26.2 
 
 
473 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>