More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0162 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5083  peptidase M16 domain-containing protein  90.38 
 
 		 468 aa  844    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0317746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0144  insulinase family metalloprotease  97.44 
 
 		 468 aa  902    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237598  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0160  peptidase M16 domain-containing protein  95.51 
 
 		 468 aa  889    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0162  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 468 aa  950    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0068  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  61.23 
 
 		 458 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0119  peptidase, M16 family  60.61 
 
 		 459 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0035  peptidase M16-like  64.24 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0462625  normal  0.189668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72250  putative metalloprotease  53.33 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6271  putative metalloprotease  52.38 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  21.25 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  27.36 
 
 		 840 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  20.96 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  20.96 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  20.96 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  20.96 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  20.96 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  20.96 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  20.96 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  24.83 
 
 		 954 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  20.96 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  20.96 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  23.68 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  26.04 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  21.43 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  26.81 
 
 		 878 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  24.32 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  20.95 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  24.82 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  24.86 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  24.44 
 
 		 432 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  21.36 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  26.52 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  24.39 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  25.07 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  20.05 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  21.97 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25 
 
 		 945 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.46 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  21.15 
 
 		 399 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  21.41 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  22.54 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  24.83 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  27.1 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  27.59 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1699  M16 family peptidase  23.44 
 
 		 872 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  26.01 
 
 		 879 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.78 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  28.24 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  27.03 
 
 		 943 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  24.75 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  24.75 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  27.38 
 
 		 940 aa  70.5  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  23.93 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  26.11 
 
 		 949 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  26.36 
 
 		 944 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  23.68 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  26.59 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  24.04 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  25.15 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  24.07 
 
 		 868 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  31.46 
 
 		 963 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  24.62 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.07 
 
 		 949 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  21.85 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  25.66 
 
 		 949 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  24.82 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  26.43 
 
 		 949 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.98 
 
 		 853 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  23.49 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  23.46 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  20.24 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1147  peptidase M16 domain protein  22.14 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  22.59 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  21.84 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.08 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  25.53 
 
 		 944 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  24.04 
 
 		 464 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  24.6 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  24.41 
 
 		 943 aa  67  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  26.46 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  26.82 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  20.43 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  22.61 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  22.61 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  21.31 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  22.61 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  23.5 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  23.5 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  28.4 
 
 		 928 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  18.84 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  22.1 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  26.47 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  24.33 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  24.25 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  22.54 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>