More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0035 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0035  peptidase M16-like  100 
 
 
463 aa  933    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0462625  normal  0.189668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0068  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  66.01 
 
 
458 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0119  peptidase, M16 family  66.96 
 
 
459 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5083  peptidase M16 domain-containing protein  64.07 
 
 
468 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0317746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0162  peptidase M16 domain-containing protein  63.16 
 
 
468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0144  insulinase family metalloprotease  62.94 
 
 
468 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237598  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0160  peptidase M16 domain-containing protein  63.44 
 
 
468 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72250  putative metalloprotease  54.52 
 
 
457 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6271  putative metalloprotease  52.74 
 
 
457 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  25.81 
 
 
469 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  21.24 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  27.25 
 
 
448 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  26.04 
 
 
489 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  27.25 
 
 
448 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  27.06 
 
 
453 aa  86.7  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  22.54 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  29.76 
 
 
840 aa  85.9  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  23.04 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  24.93 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  30.29 
 
 
878 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  25.2 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  29.03 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  25.65 
 
 
464 aa  84  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  28.31 
 
 
484 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  24.41 
 
 
463 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  26.44 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  25.77 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  27.67 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  21.81 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  27.52 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  29.67 
 
 
853 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1147  peptidase M16 domain protein  22.91 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  19.6 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  29.95 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  25.62 
 
 
514 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  21.09 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  28.42 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.89 
 
 
506 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  29.44 
 
 
494 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  27.18 
 
 
428 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  27.94 
 
 
484 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  24.48 
 
 
464 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  21.39 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  21.73 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  24.12 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  27.18 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  23.73 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  21.41 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  21.41 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  21.41 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  21.41 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  21.41 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  21.41 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  21.41 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  24.42 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  21.41 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  22.57 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  25.59 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  26.7 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  24.55 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  27.63 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  28.4 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  23.64 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  24.7 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0560  peptidase M16 domain protein  25.74 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  21.89 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0396  peptidase, M16 family  25.74 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  21.83 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.72 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  23.48 
 
 
513 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  22.94 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  29.91 
 
 
948 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  28.79 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  21.66 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  28.28 
 
 
501 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  28.74 
 
 
530 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  29.21 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 
947 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  24.61 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  23.38 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  22.34 
 
 
399 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  21.46 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  28.83 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  27.42 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
456 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  27.62 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  27.04 
 
 
928 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  25.19 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0088  M16 family peptidase  27.86 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0575485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  28.93 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  27.83 
 
 
948 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  28.1 
 
 
489 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  19.65 
 
 
438 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  24.73 
 
 
413 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  24.77 
 
 
1442 aa  66.6  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>