More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0088 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0088  M16 family peptidase  100 
 
 		 405 aa  834    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0575485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3480  peptidase M16 domain protein  38.2 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2952  peptidase M16 domain protein  37.71 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0050  peptidase M16 domain protein  38.29 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3032  zinc protease  35.8 
 
 		 412 aa  265  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  37.23 
 
 		 418 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  33.91 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  34.96 
 
 		 418 aa  229  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  34.23 
 
 		 462 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  33 
 
 		 411 aa  229  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  34.55 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  33.5 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  33.09 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  34.94 
 
 		 453 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  34.31 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  33.9 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  34.32 
 
 		 422 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  33.5 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  30.95 
 
 		 447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  34.07 
 
 		 451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  33.74 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  30.58 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  31.05 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  31.3 
 
 		 445 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  31.45 
 
 		 417 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  33.5 
 
 		 429 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  33 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  34.61 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1147  peptidase M16 domain protein  34.46 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  32.18 
 
 		 453 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  31.39 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  31.39 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  31.39 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  31.39 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  31.39 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  31.39 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  31.39 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  31.39 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  31.39 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  31.94 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  32.43 
 
 		 442 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  33.69 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  31.7 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  32.07 
 
 		 418 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  30.84 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  32.59 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  31.68 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  31.23 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2188  peptidase M16 domain protein  35.48 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.344972  normal  0.666529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  34.26 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  32.84 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0411  M16 family peptidase  33.78 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.887609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  32.67 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  32.67 
 
 		 429 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  30.39 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  32.35 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  32.18 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  32.84 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  31.11 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  32.75 
 
 		 429 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 		 422 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  30.73 
 
 		 429 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  31.93 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  30.75 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  30.52 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  30.68 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  31.62 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  30.48 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  31.68 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  31.93 
 
 		 419 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  32.26 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  30.83 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  33.17 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1414  processing peptidase  31.75 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.186097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  30.89 
 
 		 441 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  31.44 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  29.93 
 
 		 441 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  32.12 
 
 		 423 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2291  peptidase M16 domain-containing protein  33.99 
 
 		 440 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  30.83 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  29.72 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  31.13 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  30.9 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  30.25 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  32.58 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1953  peptidase M16 domain protein  34.57 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  31.33 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  31.08 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  31.08 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  32.16 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10390  predicted Zn-dependent peptidase  30.33 
 
 		 446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193865  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  30.56 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  30.56 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  30.56 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 		 424 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  32.68 
 
 		 444 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  30.9 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  29.06 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>