More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5083 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_5083  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
468 aa  944    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0317746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0144  insulinase family metalloprotease  89.96 
 
 
468 aa  836    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237598  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0162  peptidase M16 domain-containing protein  90.38 
 
 
468 aa  844    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0160  peptidase M16 domain-containing protein  91.24 
 
 
468 aa  851    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0035  peptidase M16-like  65.6 
 
 
463 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0462625  normal  0.189668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0068  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  61.93 
 
 
458 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0119  peptidase, M16 family  61.45 
 
 
459 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6271  putative metalloprotease  53.1 
 
 
457 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72250  putative metalloprotease  53.33 
 
 
457 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  26.37 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  26.01 
 
 
954 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  25.56 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  27.25 
 
 
840 aa  83.2  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  21.25 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  20.68 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  20.68 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  20.68 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  20.68 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  20.68 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  20.68 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  20.68 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  20.68 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  20.68 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  24.38 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  26.4 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  20.84 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  26.37 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  26.02 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  27.08 
 
 
878 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  21.51 
 
 
413 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.97 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  23.65 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  25.59 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  26.74 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  24.62 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  26.1 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  26.63 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  21.04 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  21.18 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0177  peptidase M16 domain protein  24.21 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  26.91 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  21.69 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  18.99 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.17 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  27.71 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  28.17 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  23.62 
 
 
411 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 
448 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  24.36 
 
 
414 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  26.24 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  22.8 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  26.87 
 
 
879 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  24.19 
 
 
451 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  20.85 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  23.04 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  25.8 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  27.59 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 
530 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  25.44 
 
 
484 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  22.61 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.46 
 
 
943 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  27.11 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  25 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  25.91 
 
 
494 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  21.41 
 
 
438 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  26.22 
 
 
451 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  25.33 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 
949 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  28.64 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  21.97 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.98 
 
 
853 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  23.72 
 
 
945 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 
949 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  25.46 
 
 
949 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  23.15 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  23.05 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  25.3 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1699  M16 family peptidase  23.19 
 
 
872 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  25.3 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0396  peptidase, M16 family  25.22 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 
944 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0560  peptidase M16 domain protein  25.22 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  22.78 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  22.78 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  22.78 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  24.05 
 
 
501 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  23.5 
 
 
441 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  24.52 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  23.08 
 
 
461 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  23.88 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  23.5 
 
 
441 aa  67  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  24.57 
 
 
944 aa  67  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  26.16 
 
 
949 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4588  processing peptidase  26.3 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  24.23 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  26.09 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 
937 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  24.23 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0398438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>