More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0160 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0144  insulinase family metalloprotease  95.3 
 
 		 468 aa  882    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237598  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5083  peptidase M16 domain-containing protein  91.24 
 
 		 468 aa  850    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0317746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0160  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 468 aa  945    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0162  peptidase M16 domain-containing protein  95.51 
 
 		 468 aa  889    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0068  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  61.67 
 
 		 458 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0119  peptidase, M16 family  60.61 
 
 		 459 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0035  peptidase M16-like  64.46 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0462625  normal  0.189668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72250  putative metalloprotease  54.52 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6271  putative metalloprotease  53.1 
 
 		 457 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  26.17 
 
 		 954 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  27.04 
 
 		 840 aa  82.4  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  26.4 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  25.96 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  23.68 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  20.4 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  29.13 
 
 		 878 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  21.43 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  20.7 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  20.99 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  20.99 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  20.7 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  20.7 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  20.7 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  20.7 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  20.7 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  25.49 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  25.49 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  20.7 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  27.66 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  20.95 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  24.32 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  25.5 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.07 
 
 		 945 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  25.2 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  25.5 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  22.33 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  26.61 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  26.46 
 
 		 879 aa  75.1  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1699  M16 family peptidase  23.5 
 
 		 872 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  25.34 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  24.36 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  27.38 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.57 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  22.25 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  26.23 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  26.02 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  29 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  27.32 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  25.39 
 
 		 868 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  27.71 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  27.71 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  28.33 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  27.38 
 
 		 940 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  27.59 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  26.11 
 
 		 949 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  25.66 
 
 		 949 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  24.22 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  20.34 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.78 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.39 
 
 		 943 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  25.41 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  25.89 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.11 
 
 		 949 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  25.76 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  25.48 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  21.18 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  25.42 
 
 		 944 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  23.51 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  26.43 
 
 		 949 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  22.92 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  22.13 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  22.54 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  23.33 
 
 		 937 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  25.59 
 
 		 944 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  24.41 
 
 		 943 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  26.67 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.98 
 
 		 853 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  27.24 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  22.96 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  23.19 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  25.59 
 
 		 944 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  23.96 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  23.96 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0177  peptidase M16 domain protein  23.05 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.49 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 		 950 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  26.52 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  29.19 
 
 		 978 aa  67.8  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  25.45 
 
 		 944 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  25.85 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  29.07 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  26.22 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  22.31 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  22.31 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 		 950 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  22.31 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  26.79 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  19.12 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>