More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0068 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0119  peptidase, M16 family  94.3 
 
 		 459 aa  856    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0068  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  100 
 
 		 458 aa  929    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0035  peptidase M16-like  67.43 
 
 		 463 aa  571  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0462625  normal  0.189668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0162  peptidase M16 domain-containing protein  61.23 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0160  peptidase M16 domain-containing protein  61.67 
 
 		 468 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0144  insulinase family metalloprotease  61.23 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237598  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5083  peptidase M16 domain-containing protein  61.93 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0317746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72250  putative metalloprotease  52.62 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6271  putative metalloprotease  51.9 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  26.76 
 
 		 878 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  26.27 
 
 		 494 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  25.74 
 
 		 477 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  28.98 
 
 		 840 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.27 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  29.46 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  29.46 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  26.73 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  24.48 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  24.33 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.45 
 
 		 896 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  23.51 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  24.8 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  24.48 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  29.6 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  29.6 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  22.9 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  23.86 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  28 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  28.8 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  26.43 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  25.82 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  24.8 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  28.09 
 
 		 924 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  21.45 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  25.07 
 
 		 868 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  26.87 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1699  M16 family peptidase  25.8 
 
 		 872 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  22.67 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  23.84 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  26.22 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  24.2 
 
 		 937 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  24.8 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  19.65 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  26.64 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  28.29 
 
 		 919 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  29.13 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  27.62 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 		 940 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1343  peptidase M16 domain-containing protein  26.79 
 
 		 951 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.690972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  24.67 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  20.38 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  28.99 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  29.86 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  20.47 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  23.08 
 
 		 912 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  26.94 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  22.01 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 		 853 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  26.7 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  28.09 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  26.36 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  27.02 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  28.89 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  25.91 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  17.24 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  25.87 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  23.91 
 
 		 954 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  25.33 
 
 		 927 aa  67.4  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  27.11 
 
 		 937 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  27.84 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  28.85 
 
 		 450 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.17 
 
 		 450 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  25.51 
 
 		 943 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  23.92 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  22.2 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  24.02 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  23.34 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  22.81 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  26.45 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  28.16 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  22.2 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  19.35 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  19.35 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  19.35 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  19.35 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  19.35 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  19.65 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.89 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  25.27 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  19.35 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  24.09 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  19.35 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 		 928 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  27.94 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  19.49 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0396  peptidase, M16 family  35.83 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>