106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68734 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_68734  D-xylulokinase  100 
 
 
623 aa  1296    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08790  D-xylulose kinase (AFU_orthologue; AFUA_5G09840)  40.14 
 
 
581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03870  xylulokinase, putative  33.39 
 
 
626 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03870  xylulokinase, putative  33.39 
 
 
626 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2626  Xylulokinase  27.25 
 
 
518 aa  104  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.758251  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.42 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.42 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  25.27 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  23.54 
 
 
463 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  24.16 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  23.84 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  23.96 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  23.2 
 
 
478 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  23.88 
 
 
488 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  23.08 
 
 
493 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  24.85 
 
 
501 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  22.71 
 
 
486 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  23.08 
 
 
493 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.33 
 
 
489 aa  65.1  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  23.72 
 
 
458 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  22.71 
 
 
486 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  22.71 
 
 
486 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  23.8 
 
 
494 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  23.55 
 
 
475 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  24.18 
 
 
485 aa  64.7  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  23.55 
 
 
475 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  23.55 
 
 
475 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  23.55 
 
 
475 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  24.72 
 
 
505 aa  64.3  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  23.01 
 
 
501 aa  63.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  23.27 
 
 
496 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.04 
 
 
518 aa  61.2  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  23.37 
 
 
493 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  23.39 
 
 
493 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  26.67 
 
 
498 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  24.11 
 
 
499 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  22.1 
 
 
488 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  21.37 
 
 
488 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  21.37 
 
 
488 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.42 
 
 
515 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  20.75 
 
 
487 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  23.54 
 
 
509 aa  58.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  20.77 
 
 
492 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  21.08 
 
 
488 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.11 
 
 
509 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  22.55 
 
 
510 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  24.05 
 
 
485 aa  57.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  22.35 
 
 
461 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  21.17 
 
 
492 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  21.17 
 
 
492 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  22.97 
 
 
483 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  21.17 
 
 
492 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  21.04 
 
 
492 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  22.56 
 
 
499 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  23.67 
 
 
487 aa  55.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  22 
 
 
493 aa  54.3  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28 
 
 
496 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  24 
 
 
511 aa  54.3  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.91 
 
 
500 aa  54.3  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  23.45 
 
 
492 aa  53.9  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.29 
 
 
499 aa  53.9  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  22.05 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  21.64 
 
 
508 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  22 
 
 
498 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.2 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  22.4 
 
 
460 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  23.29 
 
 
498 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.2 
 
 
506 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.96 
 
 
502 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  21.2 
 
 
484 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  20.57 
 
 
491 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.45 
 
 
496 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  21.11 
 
 
489 aa  51.2  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  23.68 
 
 
469 aa  51.2  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.01 
 
 
501 aa  50.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  25.27 
 
 
481 aa  50.4  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  22.9 
 
 
480 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  21.14 
 
 
490 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  21.14 
 
 
493 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  21.14 
 
 
490 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  21.14 
 
 
490 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  21.14 
 
 
493 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  21.14 
 
 
493 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  21.14 
 
 
490 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  24.73 
 
 
499 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  22.1 
 
 
478 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  20.19 
 
 
484 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  22.68 
 
 
483 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  21.41 
 
 
496 aa  48.5  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  22.68 
 
 
483 aa  48.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  22.47 
 
 
478 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  23.28 
 
 
512 aa  48.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  20.14 
 
 
509 aa  47.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  23.97 
 
 
460 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  20.66 
 
 
484 aa  47.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  22.91 
 
 
486 aa  46.2  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  20.16 
 
 
483 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  24.5 
 
 
480 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  23.18 
 
 
492 aa  46.6  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  19.95 
 
 
494 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>