116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL03870 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL03870  xylulokinase, putative  100 
 
 
626 aa  1290    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03870  xylulokinase, putative  100 
 
 
626 aa  1290    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08790  D-xylulose kinase (AFU_orthologue; AFUA_5G09840)  37.75 
 
 
581 aa  350  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68734  D-xylulokinase  33.23 
 
 
623 aa  288  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2626  Xylulokinase  28.8 
 
 
518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.758251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  31.55 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  26.91 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28 
 
 
492 aa  73.9  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28 
 
 
492 aa  73.9  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  31.1 
 
 
491 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  24.77 
 
 
484 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  25.15 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  30.5 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  24.92 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.15 
 
 
500 aa  67  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.64 
 
 
489 aa  67  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  26.21 
 
 
488 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  26.21 
 
 
486 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  26.61 
 
 
510 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  26.89 
 
 
481 aa  66.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  21.85 
 
 
501 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  25.81 
 
 
475 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  25.81 
 
 
486 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  25.81 
 
 
475 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  25.81 
 
 
475 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  25.81 
 
 
486 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  25.81 
 
 
486 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  25.81 
 
 
475 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  23.81 
 
 
494 aa  65.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  26.3 
 
 
478 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  26.3 
 
 
478 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  24.77 
 
 
494 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  22.97 
 
 
500 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  25.81 
 
 
488 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  25.81 
 
 
488 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  25 
 
 
481 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  26.4 
 
 
493 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  25.4 
 
 
488 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  23.78 
 
 
485 aa  61.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  24.48 
 
 
484 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  26 
 
 
493 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.53 
 
 
496 aa  60.8  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  27.83 
 
 
480 aa  60.1  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  25.85 
 
 
499 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.6 
 
 
518 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  25.38 
 
 
487 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  24.62 
 
 
485 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  27.32 
 
 
483 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  26.97 
 
 
461 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  29.61 
 
 
489 aa  58.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  29.41 
 
 
490 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  29.41 
 
 
490 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  28.64 
 
 
485 aa  57.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  29.41 
 
 
490 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  29.41 
 
 
493 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  29.41 
 
 
490 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  29.41 
 
 
493 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  29.41 
 
 
493 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  24.22 
 
 
515 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  25.66 
 
 
498 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  26.61 
 
 
491 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  24.9 
 
 
479 aa  55.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  25 
 
 
484 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  27.54 
 
 
483 aa  54.7  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  27.54 
 
 
483 aa  54.7  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  26.21 
 
 
493 aa  54.7  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  25.48 
 
 
465 aa  54.7  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  24.12 
 
 
508 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  22.84 
 
 
490 aa  53.9  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  26.79 
 
 
488 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.29 
 
 
511 aa  53.9  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  25 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  25.85 
 
 
484 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  25.85 
 
 
484 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  25.85 
 
 
484 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  25 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  25.7 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  25.3 
 
 
487 aa  53.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  25.79 
 
 
493 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  25.79 
 
 
493 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  25 
 
 
493 aa  52.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  25.79 
 
 
493 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  24.46 
 
 
517 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  24.23 
 
 
488 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  23.65 
 
 
463 aa  51.6  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  24.46 
 
 
517 aa  51.2  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  24.46 
 
 
511 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  23.84 
 
 
498 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.75 
 
 
499 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  23.17 
 
 
511 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  22.71 
 
 
492 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  27.41 
 
 
483 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  19.44 
 
 
509 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  24.77 
 
 
484 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  26.21 
 
 
533 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  28.78 
 
 
501 aa  48.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.36 
 
 
502 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  24.21 
 
 
484 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  24.21 
 
 
484 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  24.21 
 
 
484 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>