More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18524 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05662  threonyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13700)  47.38 
 
 		 722 aa  638    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00480  threonine-tRNA ligase, putative  48.6 
 
 		 772 aa  680    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.3781  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78070  threonyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 730 aa  734    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24771  predicted protein  50.91 
 
 		 674 aa  704    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.246652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18524  predicted protein  100 
 
 		 766 aa  1608    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 640 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 640 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 639 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 639 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 640 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 640 aa  502  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 639 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 639 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 639 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 639 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 640 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 639 aa  497  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 638 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 640 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 640 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 635 aa  492  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 633 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 636 aa  487  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 638 aa  488  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 645 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 644 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 637 aa  480  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 637 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 640 aa  482  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 636 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 636 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 635 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 635 aa  475  1e-132  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 645 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 636 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 634 aa  475  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 631 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 643 aa  472  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 638 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 634 aa  467  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 639 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 635 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 644 aa  465  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 644 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 662 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 657 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 640 aa  458  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 637 aa  458  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 605 aa  458  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 641 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 635 aa  459  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 584 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 649 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 633 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 647 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 644 aa  452  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 644 aa  452  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 645 aa  452  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 643 aa  450  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 636 aa  452  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 648 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 657 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 644 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1873  threonyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 681 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 637 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 637 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0066  threonyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 602 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 634 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 638 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 646 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 609 aa  443  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 638 aa  446  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 643 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  42.18 
 
 		 582 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1981  threonyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 650 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 641 aa  446  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 588 aa  445  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 582 aa  442  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 644 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 657 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 644 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 643 aa  442  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1896  threonyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 650 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 646 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 687 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 641 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 649 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 642 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 675 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 660 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0597  threonyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 638 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1982  threonyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 650 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.570096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2020  threonyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 635 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2099  threonyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 635 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 644 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 606 aa  436  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>