More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1982 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
644 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1873  threonyl-tRNA synthetase  83.15 
 
 
681 aa  1130    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
635 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1896  threonyl-tRNA synthetase  97.08 
 
 
650 aa  1302    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
636 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
643 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1982  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
650 aa  1333    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.570096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
643 aa  635    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
644 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1981  threonyl-tRNA synthetase  97.23 
 
 
650 aa  1305    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
634 aa  636    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
645 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
636 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 
644 aa  652    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
636 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
635 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
644 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
638 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
645 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
635 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
635 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
635 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
635 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
635 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
635 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
644 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
639 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
635 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
638 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
635 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
635 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
640 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
635 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
635 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
635 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
635 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
635 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
635 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
635 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
636 aa  621  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
636 aa  618  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
635 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
635 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
640 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
635 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
635 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
644 aa  612  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
635 aa  615  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
640 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
640 aa  608  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
639 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
639 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
637 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
639 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
639 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
635 aa  609  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
643 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
641 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
639 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
634 aa  607  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
638 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
639 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
640 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
646 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
633 aa  608  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0204  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
664 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
635 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
640 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
649 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
669 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2149  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
641 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320592  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
641 aa  601  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
633 aa  601  1e-170  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
637 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
639 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
635 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1669  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
681 aa  599  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
640 aa  598  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
640 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
639 aa  598  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
688 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
640 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
637 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
637 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
639 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
640 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
640 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
633 aa  598  1e-169  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>