More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78070 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05662  threonyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13700)  56.02 
 
 		 722 aa  823    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24771  predicted protein  51.2 
 
 		 674 aa  704    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.246652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18524  predicted protein  50.8 
 
 		 766 aa  734    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00480  threonine-tRNA ligase, putative  57.83 
 
 		 772 aa  832    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.3781  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78070  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 730 aa  1519    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 639 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 640 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 640 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 640 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 639 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 639 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 635 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 635 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 639 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 638 aa  507  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 635 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 633 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 640 aa  505  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 637 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1981  threonyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 650 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 638 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 637 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 		 634 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1896  threonyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 650 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 636 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 636 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1982  threonyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 650 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.570096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 635 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 635 aa  489  1e-136  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1873  threonyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 681 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 634 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 640 aa  488  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 645 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 643 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 662 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 644 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 644 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 641 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 644 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 636 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 636 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 644 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 640 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 642 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 659 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 645 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 638 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 634 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 636 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 640 aa  474  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 645 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06621  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 638 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.296705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 635 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 637 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 635 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 641 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 639 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 643 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 646 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 641 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 647 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 653 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  42.57 
 
 		 586 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 640 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 640 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 637 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 640 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 640 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 687 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 637 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 640 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 640 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 640 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0597  threonyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 638 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56327  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06531  threonyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 638 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.218915  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 638 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 588 aa  465  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 640 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>