More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00480 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05662  threonyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13700)  50.43 
 
 
722 aa  732    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00480  threonine-tRNA ligase, putative  100 
 
 
772 aa  1614    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.3781  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18524  predicted protein  48.6 
 
 
766 aa  681    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24771  predicted protein  47.95 
 
 
674 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.246652  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78070  threonyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 
730 aa  834    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
640 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
640 aa  536  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
639 aa  535  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
639 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
640 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
639 aa  532  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
639 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
640 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
639 aa  532  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
640 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
639 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
639 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
640 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
635 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
638 aa  520  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
636 aa  519  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
635 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
633 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
634 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
636 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
662 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
635 aa  504  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
637 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  39 
 
 
640 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
635 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
639 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  43.97 
 
 
586 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
634 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
588 aa  483  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
646 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
640 aa  484  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
641 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
645 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
631 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
637 aa  482  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
644 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
643 aa  479  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
647 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
605 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
638 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
659 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  42.81 
 
 
586 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
635 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
647 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
659 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
647 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
584 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
633 aa  463  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1873  threonyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
681 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
653 aa  462  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1981  threonyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
650 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
603 aa  462  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1896  threonyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
650 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
677 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
639 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
647 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
640 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
649 aa  460  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
635 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
637 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
644 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
635 aa  459  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
657 aa  459  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
645 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
637 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
660 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
688 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1982  threonyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
650 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.570096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
648 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
644 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
675 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
648 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
635 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
643 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
635 aa  452  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
657 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
642 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
643 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
644 aa  452  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
635 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
644 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
660 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
635 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
635 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
657 aa  452  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
635 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
643 aa  451  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
635 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
635 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>