239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48999 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_48999  LCTP l-lactate permease  100 
 
 		 689 aa  1405    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  34.89 
 
 		 559 aa  167  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  38.43 
 
 		 544 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  36.6 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  36.8 
 
 		 534 aa  165  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  36.47 
 
 		 530 aa  160  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  25.63 
 
 		 578 aa  98.6  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  29.02 
 
 		 553 aa  97.4  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  31.93 
 
 		 570 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  31.84 
 
 		 585 aa  97.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  30.77 
 
 		 562 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  32.22 
 
 		 585 aa  95.5  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  31.84 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  30.33 
 
 		 569 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  31.51 
 
 		 570 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  32.08 
 
 		 570 aa  92  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  32.92 
 
 		 570 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  31.62 
 
 		 610 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  32.38 
 
 		 566 aa  89  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  29.01 
 
 		 563 aa  88.6  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  32.85 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  27.62 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  28.62 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  30.28 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  30.99 
 
 		 601 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  35.12 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  31.48 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  30.08 
 
 		 588 aa  81.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  30.48 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  31.31 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  33.72 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  29.37 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  28.04 
 
 		 563 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  41.18 
 
 		 564 aa  79.7  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  28.68 
 
 		 611 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  28.06 
 
 		 575 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  32.29 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  31.79 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  31.94 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  28.15 
 
 		 620 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  36.53 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  27.33 
 
 		 548 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  27.33 
 
 		 548 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  28.06 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  32.29 
 
 		 547 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  32.29 
 
 		 547 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  34.87 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  32.29 
 
 		 547 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  32.29 
 
 		 547 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  32.08 
 
 		 547 aa  77  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  30.71 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  28.04 
 
 		 563 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  29.38 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  25.93 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  32.49 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  41.84 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.71 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  29.31 
 
 		 570 aa  71.6  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  31.88 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  38.46 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  34.86 
 
 		 592 aa  67  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  23.29 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  38.64 
 
 		 551 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  24.58 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  24.58 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  23.63 
 
 		 551 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  23.63 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  23.29 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  23.71 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2735  L-lactate transport  31.29 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000895009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  36.27 
 
 		 552 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  34.62 
 
 		 560 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1316  L-lactate transport  37.86 
 
 		 649 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2669e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  26.59 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2909  L-lactate transport  37.86 
 
 		 649 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  33.65 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  35.51 
 
 		 548 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  33.65 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  41 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  42.35 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  37.04 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2428  L-lactate transport  33.12 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  26.11 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  35.71 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  41.77 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  29.02 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  35.82 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  41.18 
 
 		 507 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4142  L-lactate transport  31.25 
 
 		 581 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0149  glycolate permease GlcA  31.97 
 
 		 531 aa  56.6  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2673  L-lactate transport  31.11 
 
 		 532 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1446  L-lactate/H+ symporter  31.11 
 
 		 532 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.48388  normal  0.141247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>