More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5669 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5669  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  31.08 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.97 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.53 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30.97 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.53 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.53 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.53 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.53 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.53 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.15 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  32.37 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  31.02 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.86 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  29.28 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  30.91 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  30.91 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  30.91 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  30.91 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  27.93 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.36 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.51 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.09 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.79 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.28 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.13 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.79 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.58 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  30.23 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  26.91 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  30 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  33.33 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  28.64 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  25 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.36 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.18 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  28.05 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.91 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.23 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.06 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.69 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.4 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.4 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  27.03 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.15 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.34 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  27.85 
 
 		 242 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  25.79 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  26.58 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  25.12 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>