More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0411 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  100 
 
 		 489 aa  971    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  58.98 
 
 		 498 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  45.95 
 
 		 520 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  44.66 
 
 		 526 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  44.24 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  44.07 
 
 		 526 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  44.51 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  46.42 
 
 		 527 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  44.81 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  44.81 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  47.45 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  44.81 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  47.66 
 
 		 553 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  44.6 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  44.6 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  44.6 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  44.6 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  44.2 
 
 		 547 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  46.63 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  46.63 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  46.63 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  46.83 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  46.22 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  43.15 
 
 		 534 aa  360  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  41.34 
 
 		 548 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  41.41 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  42.57 
 
 		 531 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  40.92 
 
 		 768 aa  333  6e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  42.34 
 
 		 533 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  40.92 
 
 		 768 aa  329  7e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  39.8 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  40.6 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  40.73 
 
 		 549 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  39.8 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  38 
 
 		 516 aa  273  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  38 
 
 		 516 aa  273  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  37.65 
 
 		 517 aa  253  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  34.13 
 
 		 565 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  37.42 
 
 		 523 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  37.42 
 
 		 523 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  38.08 
 
 		 764 aa  238  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.9 
 
 		 532 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  35.05 
 
 		 522 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  37.04 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  36.85 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  37.02 
 
 		 508 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  29.96 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  34.9 
 
 		 560 aa  217  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  34.45 
 
 		 783 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  35.6 
 
 		 523 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  34.01 
 
 		 769 aa  210  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  32.47 
 
 		 542 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  29.98 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  35.15 
 
 		 522 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  34.34 
 
 		 526 aa  207  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  34.79 
 
 		 505 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  35.15 
 
 		 522 aa  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  36.04 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  33.61 
 
 		 767 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  35.73 
 
 		 505 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  35.97 
 
 		 508 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  33.47 
 
 		 877 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  35.57 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  29.37 
 
 		 601 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  34.17 
 
 		 726 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  35.14 
 
 		 519 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  35.98 
 
 		 867 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  29.86 
 
 		 756 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  33.4 
 
 		 508 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  32.72 
 
 		 749 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  29.85 
 
 		 787 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  35.16 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  33.5 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  33.33 
 
 		 512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  32.18 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  32.64 
 
 		 739 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  33.2 
 
 		 754 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  32.67 
 
 		 550 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  29.05 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  32.19 
 
 		 564 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  26.95 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  26.95 
 
 		 570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  29.51 
 
 		 555 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  31.04 
 
 		 587 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.37 
 
 		 579 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  27.75 
 
 		 563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  31.56 
 
 		 581 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  28.47 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  30.64 
 
 		 572 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  29.92 
 
 		 552 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  27.5 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  30.66 
 
 		 573 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  29.55 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  32.59 
 
 		 575 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  30.36 
 
 		 567 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  28.92 
 
 		 546 aa  140  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  26.83 
 
 		 552 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  31.14 
 
 		 573 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  27.06 
 
 		 577 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  31.03 
 
 		 583 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>