More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1334 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  68.99 
 
 
520 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  69.3 
 
 
527 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  72.57 
 
 
515 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  72.38 
 
 
515 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  71.54 
 
 
516 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  72.76 
 
 
515 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  71.54 
 
 
516 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  72.38 
 
 
515 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  72.38 
 
 
515 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  70.67 
 
 
547 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  95.25 
 
 
526 aa  973    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  72.76 
 
 
515 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  71.73 
 
 
516 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  71.73 
 
 
516 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  70.81 
 
 
519 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  100 
 
 
526 aa  1017    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  70.91 
 
 
516 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  72.38 
 
 
515 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  70.91 
 
 
516 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  64.55 
 
 
520 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  52.18 
 
 
553 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  45.17 
 
 
534 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  44.75 
 
 
548 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  47.25 
 
 
533 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  46.72 
 
 
531 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  44.79 
 
 
525 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  44.6 
 
 
549 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  46.48 
 
 
498 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  43.87 
 
 
489 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  41.6 
 
 
506 aa  355  8.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  42.13 
 
 
531 aa  343  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  42.15 
 
 
768 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  41.47 
 
 
506 aa  342  9e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  42.51 
 
 
768 aa  337  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  40.82 
 
 
516 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  40.82 
 
 
516 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  35.56 
 
 
565 aa  289  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  39.36 
 
 
517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  40.16 
 
 
523 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  38.49 
 
 
523 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  37.36 
 
 
523 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  34.52 
 
 
560 aa  243  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  38.74 
 
 
510 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  33.02 
 
 
549 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  32.87 
 
 
553 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  34.81 
 
 
601 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  39.01 
 
 
508 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  34.19 
 
 
542 aa  233  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  38.46 
 
 
508 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  38.66 
 
 
510 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  38.31 
 
 
510 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  35.38 
 
 
522 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  38.88 
 
 
505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  39.24 
 
 
505 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  38.99 
 
 
510 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  30.3 
 
 
756 aa  216  8e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  32.67 
 
 
532 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  36.03 
 
 
522 aa  213  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  36.03 
 
 
522 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  36.12 
 
 
526 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  34.48 
 
 
783 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  37.57 
 
 
512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  36.49 
 
 
508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  30.41 
 
 
767 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  34.2 
 
 
769 aa  200  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  34.92 
 
 
749 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  35.48 
 
 
877 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  35.53 
 
 
519 aa  186  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  36.89 
 
 
532 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  34.07 
 
 
764 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  31.98 
 
 
726 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  34.96 
 
 
867 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.49 
 
 
579 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  30.9 
 
 
570 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  31.64 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  30.57 
 
 
563 aa  153  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  28.57 
 
 
558 aa  152  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  28.5 
 
 
606 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.74 
 
 
568 aa  146  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  28.26 
 
 
568 aa  146  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  31.35 
 
 
549 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  29.68 
 
 
574 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  31.74 
 
 
573 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  26.36 
 
 
560 aa  144  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  29.81 
 
 
568 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  31.07 
 
 
588 aa  144  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.95 
 
 
570 aa  143  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  31.28 
 
 
573 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  31.72 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  31.72 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  31.72 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  31.72 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  30.24 
 
 
564 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  28.46 
 
 
546 aa  141  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.4 
 
 
568 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  27.98 
 
 
558 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  29.63 
 
 
575 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  28.32 
 
 
552 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  28.26 
 
 
587 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  30.62 
 
 
551 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>