More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1416 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  100 
 
 
498 aa  979    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  58.98 
 
 
489 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  48.46 
 
 
520 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  46.96 
 
 
526 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  46.48 
 
 
526 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  48.48 
 
 
553 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  46.9 
 
 
547 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  44.04 
 
 
519 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  44.4 
 
 
520 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.28 
 
 
515 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  46.28 
 
 
515 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.28 
 
 
515 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.07 
 
 
515 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  46.07 
 
 
515 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.07 
 
 
515 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.07 
 
 
515 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  46.72 
 
 
527 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  47.43 
 
 
516 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  47.74 
 
 
516 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  47.13 
 
 
516 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  47.13 
 
 
516 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  48.05 
 
 
516 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  46.93 
 
 
516 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  41.39 
 
 
548 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  42.04 
 
 
531 aa  348  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  41.8 
 
 
534 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  43.64 
 
 
533 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  42.35 
 
 
549 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  40.85 
 
 
525 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  40.84 
 
 
768 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  40.84 
 
 
768 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  41.83 
 
 
531 aa  322  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  41.01 
 
 
506 aa  320  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  41.41 
 
 
506 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  39.62 
 
 
516 aa  286  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  39.62 
 
 
516 aa  286  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  37.1 
 
 
517 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  33.2 
 
 
565 aa  260  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  38.96 
 
 
523 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  38.76 
 
 
523 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  36.25 
 
 
522 aa  226  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  31.18 
 
 
553 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  38.42 
 
 
526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  37.16 
 
 
783 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  36.93 
 
 
764 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  37.08 
 
 
510 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  36.81 
 
 
523 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  31.53 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  32.61 
 
 
601 aa  213  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  36.42 
 
 
510 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  39.14 
 
 
505 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  33.87 
 
 
532 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  36.06 
 
 
522 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  36.06 
 
 
522 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  38.41 
 
 
508 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  34.55 
 
 
769 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  28.96 
 
 
549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  31.96 
 
 
542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  35.91 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  36.58 
 
 
877 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  36.01 
 
 
726 aa  194  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  36.25 
 
 
505 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  36.91 
 
 
867 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  33.54 
 
 
787 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  36.54 
 
 
512 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  35.87 
 
 
510 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  36.49 
 
 
519 aa  187  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  33.89 
 
 
767 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  37.43 
 
 
508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  34.65 
 
 
749 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  36.22 
 
 
510 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  30.21 
 
 
756 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  36.01 
 
 
532 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  36.57 
 
 
485 aa  168  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  35.52 
 
 
754 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  33.11 
 
 
587 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  31 
 
 
564 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  28.97 
 
 
572 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  28.5 
 
 
545 aa  143  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  28.04 
 
 
560 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  28.57 
 
 
563 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  28.78 
 
 
568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  29.34 
 
 
570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  30.49 
 
 
575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.89 
 
 
568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  28.5 
 
 
552 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  35.13 
 
 
573 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  32.27 
 
 
568 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  33.82 
 
 
583 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  28.8 
 
 
552 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  30.24 
 
 
555 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  30.64 
 
 
556 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.18 
 
 
579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  30.09 
 
 
570 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  29.32 
 
 
568 aa  137  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  29.95 
 
 
560 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  34.73 
 
 
583 aa  136  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  30.48 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  30.17 
 
 
550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  28.34 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>