More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2232 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  100 
 
 
505 aa  971    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  69.49 
 
 
512 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  60.04 
 
 
522 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  60.2 
 
 
522 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  60.2 
 
 
522 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  56.5 
 
 
508 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  60.53 
 
 
526 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  57.2 
 
 
510 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  56.78 
 
 
510 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  55.69 
 
 
523 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  55.44 
 
 
523 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  56.73 
 
 
505 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  55.76 
 
 
508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  55.62 
 
 
510 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  57.08 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  54.43 
 
 
523 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  56.94 
 
 
508 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  46.75 
 
 
519 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  42.63 
 
 
726 aa  306  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  41.13 
 
 
769 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  46.09 
 
 
485 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  40.12 
 
 
749 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  42.48 
 
 
783 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  44.24 
 
 
877 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  42.36 
 
 
787 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  39.71 
 
 
764 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  42.32 
 
 
867 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  36.56 
 
 
534 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  37.13 
 
 
531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  39.41 
 
 
526 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  39.72 
 
 
526 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  37.72 
 
 
519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  34.55 
 
 
548 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  33.53 
 
 
565 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  39.4 
 
 
754 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.08 
 
 
515 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  38.08 
 
 
515 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  39.18 
 
 
520 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.08 
 
 
515 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.88 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  37.88 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.88 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.88 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  37.16 
 
 
520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  37.02 
 
 
547 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  35.43 
 
 
506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  36.16 
 
 
549 aa  210  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  35.77 
 
 
531 aa  209  7e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  37.4 
 
 
516 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  37.4 
 
 
516 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  39.2 
 
 
527 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  38.51 
 
 
516 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  37.92 
 
 
516 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  37.75 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  36.08 
 
 
506 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  30.89 
 
 
768 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  38.32 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  38.52 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  31.52 
 
 
525 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  39.14 
 
 
498 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  30.89 
 
 
768 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  32.95 
 
 
542 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  37.68 
 
 
739 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  34.79 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  29.37 
 
 
568 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  31.07 
 
 
553 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  28.6 
 
 
756 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  34.36 
 
 
533 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  30.34 
 
 
568 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  32.16 
 
 
560 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  33.03 
 
 
601 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  35.38 
 
 
532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  31.86 
 
 
564 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  30.96 
 
 
558 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  27.34 
 
 
552 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.46 
 
 
568 aa  177  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  33.67 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  27.79 
 
 
552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  31.02 
 
 
572 aa  173  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  28.4 
 
 
545 aa  173  7.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  29.08 
 
 
570 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  30.49 
 
 
554 aa  172  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  29.89 
 
 
575 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  29.01 
 
 
568 aa  170  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  31.41 
 
 
517 aa  170  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  27.1 
 
 
552 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  30.22 
 
 
570 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  29.94 
 
 
550 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  34.37 
 
 
573 aa  166  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  28.6 
 
 
549 aa  166  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  30.2 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  30.81 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  28.49 
 
 
556 aa  163  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  30.62 
 
 
558 aa  163  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  29.98 
 
 
541 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  27.49 
 
 
553 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  29.04 
 
 
553 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  32.67 
 
 
426 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  27.13 
 
 
587 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  29.25 
 
 
585 aa  160  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>