More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3245 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  49.19 
 
 		 749 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  100 
 
 		 877 aa  1697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  46.72 
 
 		 783 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  43.62 
 
 		 769 aa  591  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  47.1 
 
 		 754 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  46.83 
 
 		 739 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  55.2 
 
 		 867 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  50.95 
 
 		 726 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  50.66 
 
 		 787 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  48.54 
 
 		 764 aa  432  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  42.63 
 
 		 522 aa  313  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  42.22 
 
 		 522 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  44.56 
 
 		 505 aa  304  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  42.02 
 
 		 522 aa  303  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  39.09 
 
 		 523 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  42.2 
 
 		 523 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  42.2 
 
 		 523 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  40.64 
 
 		 508 aa  276  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  40.47 
 
 		 512 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  40.84 
 
 		 526 aa  267  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  39.75 
 
 		 508 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  37.22 
 
 		 510 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  37.79 
 
 		 505 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  37.33 
 
 		 519 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  37.98 
 
 		 510 aa  254  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  38.43 
 
 		 510 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  37.47 
 
 		 510 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  35.06 
 
 		 534 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  37.5 
 
 		 508 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  32.85 
 
 		 548 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  41.6 
 
 		 485 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  34.5 
 
 		 531 aa  231  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  35.55 
 
 		 526 aa  218  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  31.99 
 
 		 525 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.96 
 
 		 515 aa  211  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.96 
 
 		 515 aa  210  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  34.96 
 
 		 515 aa  210  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  35.29 
 
 		 547 aa  209  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.77 
 
 		 515 aa  209  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  30.84 
 
 		 565 aa  209  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  34.77 
 
 		 515 aa  209  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.77 
 
 		 515 aa  209  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.77 
 
 		 515 aa  209  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  32.94 
 
 		 506 aa  207  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  35.48 
 
 		 526 aa  205  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  33.52 
 
 		 520 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  37.17 
 
 		 553 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  34.25 
 
 		 519 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  36.27 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  32.94 
 
 		 506 aa  196  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  30.71 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  35.29 
 
 		 527 aa  195  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  31.49 
 
 		 542 aa  194  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  36.78 
 
 		 516 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  36.78 
 
 		 516 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  33.54 
 
 		 489 aa  191  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  36.91 
 
 		 498 aa  190  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  30.91 
 
 		 549 aa  187  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  32.3 
 
 		 560 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  36.57 
 
 		 516 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  36.01 
 
 		 516 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  35.81 
 
 		 516 aa  178  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  35.62 
 
 		 516 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.76 
 
 		 532 aa  174  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  30.33 
 
 		 568 aa  174  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.7 
 
 		 568 aa  172  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  31.58 
 
 		 531 aa  170  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  35.33 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  32.77 
 
 		 516 aa  170  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  32.77 
 
 		 516 aa  170  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  29.95 
 
 		 570 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  32.42 
 
 		 550 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  30.52 
 
 		 568 aa  168  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  30.39 
 
 		 601 aa  167  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  28.71 
 
 		 549 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  29.69 
 
 		 768 aa  164  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  30.33 
 
 		 567 aa  164  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  27.16 
 
 		 756 aa  164  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  26.9 
 
 		 563 aa  163  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  30.33 
 
 		 567 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  31 
 
 		 553 aa  163  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  29.03 
 
 		 560 aa  163  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  31.84 
 
 		 558 aa  162  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  29.69 
 
 		 768 aa  161  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  41.59 
 
 		 225 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  29.91 
 
 		 767 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  33.27 
 
 		 533 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  27.91 
 
 		 536 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  33.85 
 
 		 557 aa  156  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  28.17 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  31.15 
 
 		 556 aa  156  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  29.9 
 
 		 606 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  30.96 
 
 		 551 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  33.33 
 
 		 586 aa  153  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  30.79 
 
 		 558 aa  152  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4725  sulphate transporter  29.55 
 
 		 561 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  28.69 
 
 		 552 aa  151  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0834  sulfate permease family protein  28.51 
 
 		 492 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0878  sulfate permease family protein  28.51 
 
 		 492 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1058  sulfate permease family protein  28.31 
 
 		 492 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000677797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>