More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0642 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  100 
 
 
534 aa  1062    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  54.31 
 
 
548 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  54.72 
 
 
525 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  53.13 
 
 
549 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  50.19 
 
 
533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  50.81 
 
 
531 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  50 
 
 
506 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  50.2 
 
 
506 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  45.74 
 
 
526 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  46.64 
 
 
531 aa  415  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  45.01 
 
 
768 aa  412  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  45.01 
 
 
768 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  47.92 
 
 
553 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  45.37 
 
 
519 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  44.96 
 
 
526 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  47.85 
 
 
515 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  47.85 
 
 
515 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  48.05 
 
 
547 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  47.85 
 
 
515 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  43.13 
 
 
520 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  47.66 
 
 
515 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  47.66 
 
 
515 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  45.58 
 
 
520 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  47.66 
 
 
515 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  47.66 
 
 
515 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  47.23 
 
 
517 aa  379  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  46.08 
 
 
527 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  46.8 
 
 
516 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  46.8 
 
 
516 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  46.48 
 
 
516 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  43.44 
 
 
516 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  46.6 
 
 
516 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  43.44 
 
 
516 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  46.41 
 
 
516 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  46.24 
 
 
516 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  42.74 
 
 
489 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  38.33 
 
 
565 aa  309  8e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  41.8 
 
 
498 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  36.07 
 
 
560 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  38.22 
 
 
783 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  37.43 
 
 
522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  36.65 
 
 
542 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  33.27 
 
 
553 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  37.07 
 
 
764 aa  256  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  35.41 
 
 
532 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  33.99 
 
 
549 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  36.04 
 
 
523 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  36.24 
 
 
523 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  37.89 
 
 
508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  36.63 
 
 
522 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  36.43 
 
 
522 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  35.98 
 
 
505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  35.79 
 
 
769 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  30.75 
 
 
756 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  37.65 
 
 
508 aa  233  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  35.71 
 
 
526 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  32.27 
 
 
601 aa  230  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  34.77 
 
 
510 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  34.98 
 
 
877 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  34.65 
 
 
767 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  35.2 
 
 
512 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  34.57 
 
 
510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  35.91 
 
 
726 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  35.57 
 
 
523 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  33.81 
 
 
532 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  34.12 
 
 
510 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  34.64 
 
 
505 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  31.01 
 
 
787 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  34.18 
 
 
510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  34.65 
 
 
508 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  31.08 
 
 
749 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  34.65 
 
 
519 aa  193  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  33.73 
 
 
867 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  34.28 
 
 
485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  29.05 
 
 
568 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  29.57 
 
 
570 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  31.35 
 
 
560 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  28.4 
 
 
560 aa  166  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  28.25 
 
 
568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  30.1 
 
 
568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  32.73 
 
 
739 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  28.92 
 
 
564 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  33.4 
 
 
754 aa  156  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  27.05 
 
 
554 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.41 
 
 
579 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  29.79 
 
 
550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  28.6 
 
 
588 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  30.32 
 
 
568 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.81 
 
 
570 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  27.45 
 
 
563 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  26.68 
 
 
541 aa  151  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  28.64 
 
 
556 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  28.05 
 
 
567 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  29.26 
 
 
563 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  28.51 
 
 
567 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  27.53 
 
 
563 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  28.6 
 
 
552 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  27.15 
 
 
587 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  28.39 
 
 
574 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  27.37 
 
 
573 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>