More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0115 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  100 
 
 		 510 aa  1001    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  95.64 
 
 		 505 aa  904    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  72.94 
 
 		 523 aa  692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  78.82 
 
 		 510 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  79.41 
 
 		 510 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  80 
 
 		 508 aa  755    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  90.12 
 
 		 508 aa  818    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  96.08 
 
 		 510 aa  894    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  75.84 
 
 		 523 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  76.04 
 
 		 523 aa  726    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  55.62 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  51.62 
 
 		 522 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  53.07 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  53.07 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  54.29 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  54.09 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  47.99 
 
 		 508 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  45.08 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  41.55 
 
 		 783 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  42.48 
 
 		 726 aa  306  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  42.74 
 
 		 749 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  40.49 
 
 		 769 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  44.56 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  39.63 
 
 		 787 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  39.18 
 
 		 764 aa  280  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  40.16 
 
 		 867 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  37 
 
 		 519 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  38.94 
 
 		 520 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  39.44 
 
 		 526 aa  256  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  38.97 
 
 		 526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  37.4 
 
 		 877 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  35.11 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  42.24 
 
 		 754 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  37.5 
 
 		 531 aa  240  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  37.65 
 
 		 520 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  35.06 
 
 		 525 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  32.14 
 
 		 565 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  36.91 
 
 		 516 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  36.91 
 
 		 516 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  33.27 
 
 		 548 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  37.45 
 
 		 516 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  40.46 
 
 		 553 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.33 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  35.33 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.33 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  35.83 
 
 		 547 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.28 
 
 		 515 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.28 
 
 		 515 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  35.28 
 
 		 515 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.28 
 
 		 515 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  37.31 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  36.73 
 
 		 516 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  32.28 
 
 		 542 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  36.04 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  34.69 
 
 		 506 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  33.79 
 
 		 531 aa  205  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  36.95 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  33.01 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  32.78 
 
 		 768 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  37.27 
 
 		 498 aa  199  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  32.78 
 
 		 768 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  35.66 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  34.79 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  29.72 
 
 		 756 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  32.26 
 
 		 572 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  32.2 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  29.03 
 
 		 553 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  31.19 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  30.25 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  35.91 
 
 		 573 aa  180  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  30.56 
 
 		 549 aa  178  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  32.37 
 
 		 516 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  32.37 
 
 		 516 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  30.08 
 
 		 517 aa  169  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  32.99 
 
 		 555 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  31.83 
 
 		 559 aa  168  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  35.59 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.74 
 
 		 577 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  28.97 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  30.77 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  30.49 
 
 		 585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  34.72 
 
 		 575 aa  163  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  33.25 
 
 		 767 aa  163  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.77 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  32.91 
 
 		 564 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  28.54 
 
 		 558 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  32.67 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  34.24 
 
 		 581 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  37.59 
 
 		 516 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  29.13 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  27.65 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.51 
 
 		 568 aa  154  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  25.4 
 
 		 545 aa  154  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  32.72 
 
 		 548 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  32.11 
 
 		 560 aa  153  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  30.93 
 
 		 570 aa  153  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02853  low affinity sulfate transporter  30.4 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  29.39 
 
 		 558 aa  150  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  37.6 
 
 		 527 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  31.14 
 
 		 536 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>