More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0287 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  79.8 
 
 
505 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  95.68 
 
 
510 aa  941    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  100 
 
 
510 aa  1001    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  82.84 
 
 
508 aa  786    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  77.78 
 
 
508 aa  711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  73.47 
 
 
523 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  80.78 
 
 
510 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  70.37 
 
 
523 aa  688    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  73.07 
 
 
523 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  79.41 
 
 
510 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  56.78 
 
 
505 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  52.65 
 
 
522 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  53.27 
 
 
522 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  53.27 
 
 
522 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  52.75 
 
 
526 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  53.54 
 
 
512 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  50.85 
 
 
508 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  46.44 
 
 
519 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  39.75 
 
 
783 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  39.22 
 
 
769 aa  299  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  44.26 
 
 
485 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  38.97 
 
 
749 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  40.87 
 
 
764 aa  293  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  38.93 
 
 
726 aa  284  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  40.59 
 
 
867 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  40.04 
 
 
787 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  37.27 
 
 
877 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  35.1 
 
 
519 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  34.09 
 
 
565 aa  246  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  36.71 
 
 
520 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  41.43 
 
 
754 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  37.47 
 
 
531 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  38.77 
 
 
526 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  38.24 
 
 
526 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  35.17 
 
 
534 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  37.71 
 
 
520 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  32.71 
 
 
548 aa  233  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  35.95 
 
 
516 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  35.95 
 
 
516 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  35.38 
 
 
547 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  36.21 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  35.36 
 
 
516 aa  220  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.62 
 
 
515 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  34.62 
 
 
515 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.62 
 
 
515 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.62 
 
 
515 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  34.83 
 
 
515 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.83 
 
 
515 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.83 
 
 
515 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  37.33 
 
 
489 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  35.54 
 
 
527 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  33.14 
 
 
525 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  38.05 
 
 
553 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  33.78 
 
 
549 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  36.45 
 
 
516 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  36.45 
 
 
516 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  33.74 
 
 
506 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  37.22 
 
 
498 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  32.62 
 
 
531 aa  204  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  32.08 
 
 
542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  31.89 
 
 
768 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  32.3 
 
 
768 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  33.74 
 
 
506 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  29.27 
 
 
756 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  31.95 
 
 
601 aa  192  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  30.42 
 
 
549 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  33.6 
 
 
533 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  37.12 
 
 
739 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  29.2 
 
 
553 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.84 
 
 
532 aa  183  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  31.29 
 
 
517 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  29.64 
 
 
560 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  36.43 
 
 
532 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  33.99 
 
 
572 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  34.57 
 
 
581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  34.1 
 
 
575 aa  163  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  33.73 
 
 
573 aa  162  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  30.99 
 
 
557 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  32.72 
 
 
516 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  32.72 
 
 
516 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  30.19 
 
 
536 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  33.49 
 
 
767 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  32.67 
 
 
577 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  30.88 
 
 
564 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.96 
 
 
579 aa  153  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.29 
 
 
570 aa  153  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.41 
 
 
570 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  27.08 
 
 
568 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  27.96 
 
 
541 aa  152  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.61 
 
 
568 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  33.42 
 
 
581 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  28.35 
 
 
558 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  30.22 
 
 
585 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  31.22 
 
 
548 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  30.17 
 
 
583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.5 
 
 
568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  30.99 
 
 
580 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  28.6 
 
 
554 aa  147  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  33.42 
 
 
555 aa  147  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  28.25 
 
 
545 aa  146  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>