More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2297 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.48 
 
 
515 aa  741    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  88.76 
 
 
527 aa  843    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  94.19 
 
 
516 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.48 
 
 
515 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  77.48 
 
 
515 aa  741    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  77.86 
 
 
515 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.48 
 
 
515 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  94.77 
 
 
516 aa  886    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  77.09 
 
 
547 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  98.84 
 
 
516 aa  984    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.67 
 
 
515 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  70.06 
 
 
526 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  72.43 
 
 
526 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.86 
 
 
515 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  94.38 
 
 
516 aa  870    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  94.19 
 
 
516 aa  889    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  100 
 
 
516 aa  996    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  65.74 
 
 
519 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  62.28 
 
 
520 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  63.6 
 
 
520 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  52.53 
 
 
553 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  45.86 
 
 
534 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  45.37 
 
 
525 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  42.75 
 
 
548 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  46.11 
 
 
533 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  45.7 
 
 
531 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  46.22 
 
 
489 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  48.25 
 
 
498 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  44.67 
 
 
549 aa  363  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  42.37 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  42.37 
 
 
506 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  39.89 
 
 
531 aa  339  8e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  40.48 
 
 
768 aa  337  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  40.04 
 
 
768 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  40.42 
 
 
516 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  40.42 
 
 
516 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  38.88 
 
 
517 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  35.55 
 
 
565 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  34.3 
 
 
560 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  36.43 
 
 
523 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  37.26 
 
 
523 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  37.43 
 
 
523 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  33.89 
 
 
601 aa  233  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  38.32 
 
 
508 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  36.62 
 
 
510 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  36.54 
 
 
522 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  32.23 
 
 
553 aa  230  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  34.26 
 
 
542 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  36.33 
 
 
510 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  36.74 
 
 
505 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  36.75 
 
 
510 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  35.59 
 
 
510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  38.4 
 
 
526 aa  216  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  36.9 
 
 
508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  38.4 
 
 
505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  30.24 
 
 
756 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  35.01 
 
 
767 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  30.83 
 
 
549 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  36.42 
 
 
522 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  36.42 
 
 
522 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  37.1 
 
 
783 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  38.48 
 
 
512 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  36.23 
 
 
508 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  35.84 
 
 
769 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  38.97 
 
 
532 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.33 
 
 
532 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  31.98 
 
 
787 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  36.02 
 
 
764 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  35.81 
 
 
877 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  34.33 
 
 
749 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  33.91 
 
 
519 aa  183  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  34.15 
 
 
726 aa  182  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  36.42 
 
 
867 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  37.65 
 
 
485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  30.02 
 
 
563 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  33.85 
 
 
563 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.6 
 
 
570 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  29.68 
 
 
568 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.38 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  30.35 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  28.46 
 
 
585 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  26.67 
 
 
552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  27.27 
 
 
570 aa  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  30.12 
 
 
546 aa  147  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  26.02 
 
 
552 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  32.82 
 
 
549 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  32.82 
 
 
549 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.15 
 
 
568 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  33.25 
 
 
572 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  27.48 
 
 
552 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  29.95 
 
 
573 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  30.79 
 
 
588 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  26.08 
 
 
550 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  32.85 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  31.68 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  32.49 
 
 
548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  30.07 
 
 
590 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  26.11 
 
 
556 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  30.07 
 
 
590 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  26.65 
 
 
560 aa  140  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>