More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1925 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  985    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  56.5 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  54.58 
 
 		 522 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  54.58 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  54.58 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  54.99 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  54.81 
 
 		 526 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  51.05 
 
 		 510 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  50.32 
 
 		 523 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  50.85 
 
 		 523 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  50.85 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  48.8 
 
 		 505 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  49.79 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  47.99 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  48.41 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  49.8 
 
 		 508 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  48 
 
 		 523 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  43.15 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  41.65 
 
 		 769 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  41.7 
 
 		 783 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  40.21 
 
 		 764 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  43.22 
 
 		 485 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  39.5 
 
 		 726 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  39.01 
 
 		 787 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  38.41 
 
 		 749 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  37.47 
 
 		 534 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  40.24 
 
 		 877 aa  264  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  34.04 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  35.8 
 
 		 548 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  40.4 
 
 		 867 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  33.07 
 
 		 565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  35.11 
 
 		 525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  38.54 
 
 		 549 aa  233  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  36.91 
 
 		 526 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  38.9 
 
 		 754 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  36.4 
 
 		 526 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  33.4 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  34.65 
 
 		 519 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  36.42 
 
 		 531 aa  213  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  37 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  35.32 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.38 
 
 		 515 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  35.38 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.38 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  35.81 
 
 		 547 aa  206  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  35 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  35 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  37.35 
 
 		 553 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  35 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  35 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  33.66 
 
 		 506 aa  204  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  35.93 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  35.93 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  33.4 
 
 		 768 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  33.59 
 
 		 768 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  35.93 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  36.29 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  42.47 
 
 		 739 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.94 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  33.72 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  35.39 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  36.23 
 
 		 516 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  28.04 
 
 		 553 aa  189  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  36.23 
 
 		 516 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  31.46 
 
 		 601 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  35.91 
 
 		 498 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  32.12 
 
 		 560 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  31.28 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  31.34 
 
 		 568 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  31.1 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  28.17 
 
 		 756 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  30.81 
 
 		 568 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  37.11 
 
 		 532 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  30.73 
 
 		 570 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  30.23 
 
 		 553 aa  170  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  33.4 
 
 		 489 aa  170  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  28.29 
 
 		 560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  32.6 
 
 		 572 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  30.61 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  31.63 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  30.72 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  28.89 
 
 		 587 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  28.16 
 
 		 552 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  28.48 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  28.86 
 
 		 558 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  33.42 
 
 		 583 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  28.22 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  31.77 
 
 		 575 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  30.79 
 
 		 564 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  29.69 
 
 		 574 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  27.52 
 
 		 549 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  30.35 
 
 		 606 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  30.05 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  25.98 
 
 		 551 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  27.31 
 
 		 555 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  29.35 
 
 		 545 aa  150  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  27.98 
 
 		 581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  27.06 
 
 		 585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  27.9 
 
 		 579 aa  147  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.38 
 
 		 579 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>