More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2931 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  100 
 
 
525 aa  1042    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  54.65 
 
 
548 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  54.79 
 
 
534 aa  525  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  53.22 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  53.01 
 
 
531 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  51.17 
 
 
506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  51.17 
 
 
506 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  50.1 
 
 
533 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  49.8 
 
 
553 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  44.79 
 
 
526 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  45.21 
 
 
519 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  44.81 
 
 
516 aa  392  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  44.81 
 
 
516 aa  392  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  44.59 
 
 
526 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  42.83 
 
 
768 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  43.63 
 
 
531 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  43.69 
 
 
515 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  43.69 
 
 
515 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  43.88 
 
 
515 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  43.88 
 
 
515 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  43.69 
 
 
515 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  43.69 
 
 
515 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  44.66 
 
 
547 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  43.88 
 
 
515 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  42.83 
 
 
768 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  45.47 
 
 
520 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  44.02 
 
 
527 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  43.37 
 
 
520 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  45.17 
 
 
516 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  44.98 
 
 
516 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  44.6 
 
 
517 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  45.37 
 
 
516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  45.75 
 
 
516 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  45.75 
 
 
516 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  45.75 
 
 
516 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  41.41 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  40.85 
 
 
498 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  36.52 
 
 
565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  37.26 
 
 
560 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  34.99 
 
 
522 aa  240  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  35.48 
 
 
542 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  35.25 
 
 
523 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  35.25 
 
 
523 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  32.61 
 
 
553 aa  226  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  33.27 
 
 
532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  34.61 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  34.37 
 
 
508 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  34.61 
 
 
522 aa  220  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  35.11 
 
 
508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  32.13 
 
 
783 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  31.02 
 
 
601 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  33.88 
 
 
767 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  32.5 
 
 
510 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  34.62 
 
 
526 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  31.65 
 
 
549 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  33.71 
 
 
764 aa  207  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  31.53 
 
 
523 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  34.29 
 
 
510 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  34.38 
 
 
505 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  31.67 
 
 
510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  33.78 
 
 
508 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  34.3 
 
 
510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  29.62 
 
 
756 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  31.72 
 
 
505 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  30.78 
 
 
769 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  32.19 
 
 
877 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  31.66 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  30.16 
 
 
749 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  30.7 
 
 
532 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  30.75 
 
 
726 aa  180  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  29.33 
 
 
787 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  35.08 
 
 
519 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  27.51 
 
 
568 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.04 
 
 
568 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  27.83 
 
 
563 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  26.97 
 
 
560 aa  150  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  26.42 
 
 
568 aa  150  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.38 
 
 
570 aa  150  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  27.64 
 
 
583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  27.11 
 
 
552 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  27.06 
 
 
563 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  27.88 
 
 
570 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  27.79 
 
 
564 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  27.37 
 
 
572 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  28.73 
 
 
560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  27 
 
 
587 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  26.68 
 
 
552 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  28.37 
 
 
545 aa  140  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  28.15 
 
 
541 aa  140  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  26.58 
 
 
567 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  26.81 
 
 
567 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  27.88 
 
 
558 aa  137  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  28.51 
 
 
581 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  28.47 
 
 
550 aa  137  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.27 
 
 
579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  27.79 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  25.9 
 
 
553 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  25 
 
 
558 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  27.57 
 
 
551 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2760  sulphate transporter  25.16 
 
 
607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.207505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>