More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2472 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  100 
 
 
565 aa  1139    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  45.07 
 
 
542 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  44.96 
 
 
560 aa  435  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  41.31 
 
 
553 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  45.83 
 
 
532 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  45.07 
 
 
601 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  42.73 
 
 
549 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  47.32 
 
 
532 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  37.99 
 
 
756 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  37.2 
 
 
548 aa  309  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  38.33 
 
 
534 aa  309  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  36.89 
 
 
519 aa  296  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  35.69 
 
 
767 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  37.05 
 
 
506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  36.07 
 
 
526 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  35.6 
 
 
520 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  35.37 
 
 
526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  35.37 
 
 
531 aa  283  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  37.24 
 
 
506 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  36.52 
 
 
525 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  33.94 
 
 
531 aa  277  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  34.91 
 
 
520 aa  276  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  34.57 
 
 
549 aa  267  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.95 
 
 
515 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  34.88 
 
 
515 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.88 
 
 
515 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  35.15 
 
 
515 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.15 
 
 
515 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.15 
 
 
515 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.15 
 
 
515 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  35.81 
 
 
533 aa  263  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  34.18 
 
 
547 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  34.9 
 
 
516 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  34.9 
 
 
516 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  34.9 
 
 
516 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  31.73 
 
 
768 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  33.96 
 
 
527 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  31.92 
 
 
768 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  35.45 
 
 
516 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  33.4 
 
 
553 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  35.1 
 
 
516 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  34.9 
 
 
516 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  35.48 
 
 
783 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  32.63 
 
 
522 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  33.65 
 
 
510 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  33.14 
 
 
512 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  33.2 
 
 
498 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  32.43 
 
 
749 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  33.94 
 
 
523 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  33.21 
 
 
523 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  34.09 
 
 
510 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  32.63 
 
 
522 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  34.13 
 
 
489 aa  224  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  32.44 
 
 
522 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  33.21 
 
 
508 aa  223  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  31.79 
 
 
769 aa  223  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  32.75 
 
 
505 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  32.67 
 
 
526 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  33.07 
 
 
508 aa  221  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  32.33 
 
 
510 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  33.4 
 
 
516 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  33.4 
 
 
516 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  32.14 
 
 
505 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  33.33 
 
 
508 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  32.51 
 
 
523 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  32.14 
 
 
510 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  31.08 
 
 
519 aa  207  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  35.66 
 
 
517 aa  206  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  30.97 
 
 
726 aa  200  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  31.8 
 
 
764 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  33.91 
 
 
867 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  31.41 
 
 
877 aa  187  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  28.15 
 
 
551 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.79 
 
 
568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  31.18 
 
 
485 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  31.38 
 
 
754 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  29.36 
 
 
568 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  26.16 
 
 
558 aa  156  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  27.85 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  26.13 
 
 
554 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  25.66 
 
 
560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  25.47 
 
 
587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  26.13 
 
 
568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  26.58 
 
 
565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  26.74 
 
 
563 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.2 
 
 
570 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  27.06 
 
 
560 aa  147  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.22 
 
 
579 aa  146  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  25.19 
 
 
552 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  27.24 
 
 
572 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  26.76 
 
 
556 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  25.47 
 
 
567 aa  144  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  28.54 
 
 
564 aa  143  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  25.28 
 
 
567 aa  143  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  27.79 
 
 
553 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  26.34 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  25.63 
 
 
570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  26.74 
 
 
586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  25.88 
 
 
556 aa  141  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  27.97 
 
 
550 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>