More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1269 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  100 
 
 		 485 aa  910    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  44.85 
 
 		 522 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  46.7 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  44.85 
 
 		 522 aa  342  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  45.66 
 
 		 522 aa  342  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  47.15 
 
 		 505 aa  342  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  48.51 
 
 		 523 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  48.72 
 
 		 523 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  48.63 
 
 		 523 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  45.44 
 
 		 508 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  47 
 
 		 512 aa  319  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  45.32 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  44.6 
 
 		 526 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  43.22 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  42.28 
 
 		 519 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  44.98 
 
 		 510 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  45.81 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  45.99 
 
 		 510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  44.65 
 
 		 508 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  43.15 
 
 		 783 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  41.34 
 
 		 769 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  45.47 
 
 		 867 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  40.66 
 
 		 787 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  41.43 
 
 		 726 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  42.35 
 
 		 749 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  42.23 
 
 		 877 aa  253  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  38.17 
 
 		 764 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  38.68 
 
 		 531 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  34.28 
 
 		 534 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  35.96 
 
 		 526 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  31.18 
 
 		 565 aa  209  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  39.38 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  32.6 
 
 		 548 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  36.02 
 
 		 526 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  36.67 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  38.93 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  35.42 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  43.4 
 
 		 754 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  39.67 
 
 		 553 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  41.15 
 
 		 739 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  37.22 
 
 		 573 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  35.6 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  34.37 
 
 		 547 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.1 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  34.1 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  34.51 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.1 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.51 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.1 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.1 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  30.93 
 
 		 525 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  37.5 
 
 		 516 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  36.83 
 
 		 516 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  33.07 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  38.1 
 
 		 527 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  36.83 
 
 		 516 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  37.78 
 
 		 498 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  37.04 
 
 		 516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.79 
 
 		 579 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  37.4 
 
 		 575 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  34.3 
 
 		 564 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  32 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  28.57 
 
 		 549 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  38.66 
 
 		 516 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  38.26 
 
 		 516 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  34.61 
 
 		 572 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  30.33 
 
 		 601 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  29.51 
 
 		 553 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  37.22 
 
 		 581 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  35.8 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  28.11 
 
 		 542 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  31.17 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  31.71 
 
 		 768 aa  170  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  33 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  31.71 
 
 		 768 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  32.04 
 
 		 560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  31.43 
 
 		 559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  32.14 
 
 		 570 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  32.09 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  30.98 
 
 		 560 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  33.97 
 
 		 581 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  29.9 
 
 		 558 aa  159  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  29.56 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  34.97 
 
 		 577 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  30.37 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  26.38 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  33.72 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  36.96 
 
 		 580 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  29.68 
 
 		 568 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  36.73 
 
 		 555 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  30.89 
 
 		 568 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  28.6 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  33.66 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  28.17 
 
 		 587 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  35.41 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  29.93 
 
 		 756 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  28.72 
 
 		 541 aa  153  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  35.66 
 
 		 632 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  29.94 
 
 		 517 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  30.2 
 
 		 553 aa  153  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>