More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5173 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  100 
 
 		 426 aa  827    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2627  sulphate transporter  65.02 
 
 		 385 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  62.53 
 
 		 564 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  63.79 
 
 		 573 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  64.32 
 
 		 587 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  61.31 
 
 		 581 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  57.66 
 
 		 575 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  60.68 
 
 		 572 aa  464  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  59.41 
 
 		 579 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  59.47 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  64.08 
 
 		 568 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  60.73 
 
 		 555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  63.06 
 
 		 580 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  60.19 
 
 		 581 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  56.66 
 
 		 583 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  60.39 
 
 		 632 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  60.15 
 
 		 545 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  58.5 
 
 		 583 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  58.91 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  50.73 
 
 		 570 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  50.12 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  53.68 
 
 		 550 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  53.4 
 
 		 581 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  48.54 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  47.93 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  47.26 
 
 		 606 aa  362  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  46.59 
 
 		 568 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  47.07 
 
 		 553 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  47.07 
 
 		 570 aa  351  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  46.81 
 
 		 572 aa  346  5e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  44.42 
 
 		 545 aa  341  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  46.59 
 
 		 559 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  43.81 
 
 		 552 aa  336  5e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  45.61 
 
 		 556 aa  334  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  44.84 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  44.31 
 
 		 551 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  42.26 
 
 		 605 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  44.2 
 
 		 587 aa  328  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2760  sulphate transporter  51.18 
 
 		 607 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.207505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  43.83 
 
 		 551 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  47.26 
 
 		 552 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  49.16 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  43.1 
 
 		 552 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  47.42 
 
 		 554 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  45.89 
 
 		 567 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  45.41 
 
 		 567 aa  318  9e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  43.57 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  44.23 
 
 		 541 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  44.65 
 
 		 558 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  43.24 
 
 		 560 aa  312  7.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  44.52 
 
 		 563 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  46.99 
 
 		 586 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  43 
 
 		 583 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  46.21 
 
 		 552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  44.84 
 
 		 587 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  44.61 
 
 		 551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  43.06 
 
 		 563 aa  302  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  46.37 
 
 		 559 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  46.87 
 
 		 553 aa  299  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  41.78 
 
 		 573 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  44.24 
 
 		 556 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  39.73 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  39.73 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  40.18 
 
 		 588 aa  289  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  39.42 
 
 		 590 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  39.59 
 
 		 574 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  42.56 
 
 		 565 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  42.56 
 
 		 565 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  39.5 
 
 		 587 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  39.5 
 
 		 587 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  39.5 
 
 		 587 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  40.09 
 
 		 585 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  39.5 
 
 		 587 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  42.33 
 
 		 565 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  41.33 
 
 		 560 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  45.38 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  39.46 
 
 		 563 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  41.26 
 
 		 567 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1792  sulfate transporter  41.75 
 
 		 571 aa  269  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2268  putative sulfate transporter YchM  41.03 
 
 		 572 aa  269  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1995  putative sulfate transporter YchM  42.19 
 
 		 562 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  41.51 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  40.81 
 
 		 579 aa  262  6.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01181  predicted transporter  40.05 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1936  putative sulfate transporter YchM  40.05 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016191  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1687  putative sulfate transporter YchM  40.05 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000554758  normal  0.520634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01191  hypothetical protein  40.05 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.818983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1540  putative sulfate transporter YchM  40.73 
 
 		 561 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0985805  normal  0.161381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  38.46 
 
 		 575 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1356  putative sulfate transporter YchM  40.73 
 
 		 561 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0275368  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1914  putative sulfate transporter YchM  40.73 
 
 		 561 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.200297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1978  putative sulfate transporter YchM  40.73 
 
 		 561 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2441  sulfate transporter  40.14 
 
 		 550 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1353  putative sulfate transporter YchM  40.14 
 
 		 550 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000101083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2420  putative sulfate transporter YchM  40.14 
 
 		 550 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.643639  hitchhiker  0.00551985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1311  putative sulfate transporter YchM  40.14 
 
 		 550 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000228855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1920  putative sulfate transporter YchM  40.73 
 
 		 561 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0235525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2342  putative sulfate transporter YchM  40.86 
 
 		 560 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  37.64 
 
 		 573 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1370  putative sulfate transporter YchM  40.05 
 
 		 559 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000347462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>