More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5226 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  100 
 
 
867 aa  1664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  49.19 
 
 
783 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  50.66 
 
 
749 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  49.26 
 
 
726 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  46.98 
 
 
769 aa  581  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  46.04 
 
 
787 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  48.24 
 
 
764 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  47.81 
 
 
754 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  55.2 
 
 
877 aa  495  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  46.69 
 
 
739 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  43.78 
 
 
522 aa  300  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  42.5 
 
 
510 aa  300  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  41.97 
 
 
523 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  42.56 
 
 
523 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  43.78 
 
 
522 aa  291  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  43.78 
 
 
522 aa  291  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  41.84 
 
 
523 aa  286  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  44.27 
 
 
526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  42.68 
 
 
505 aa  284  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  42.36 
 
 
512 aa  280  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  41.73 
 
 
508 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  41 
 
 
510 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  40.78 
 
 
505 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  41.84 
 
 
508 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  40.78 
 
 
510 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  40.44 
 
 
510 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  40.56 
 
 
508 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  45.99 
 
 
485 aa  253  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  39.88 
 
 
519 aa  253  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  33.91 
 
 
565 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  28.53 
 
 
768 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  33.73 
 
 
534 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  28.84 
 
 
768 aa  228  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  37.4 
 
 
520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  35.29 
 
 
526 aa  214  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  35.88 
 
 
531 aa  211  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  32.73 
 
 
548 aa  210  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  34.96 
 
 
526 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  35.46 
 
 
515 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.46 
 
 
515 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.46 
 
 
515 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.46 
 
 
515 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  35.22 
 
 
547 aa  205  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.46 
 
 
515 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.46 
 
 
515 aa  204  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  35.46 
 
 
515 aa  204  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  35.01 
 
 
520 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  33.27 
 
 
531 aa  199  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  36.91 
 
 
498 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  33.74 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  31.82 
 
 
506 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  36.06 
 
 
516 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  36.06 
 
 
516 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  36.12 
 
 
489 aa  194  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  34.87 
 
 
527 aa  193  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  31.98 
 
 
553 aa  191  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  33.08 
 
 
532 aa  190  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  36.2 
 
 
516 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  36.06 
 
 
516 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  31.62 
 
 
506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  34.24 
 
 
560 aa  184  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  36.49 
 
 
516 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  35.75 
 
 
549 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  36.49 
 
 
516 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  36.31 
 
 
553 aa  180  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  30.42 
 
 
525 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  31.37 
 
 
756 aa  177  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  29.37 
 
 
542 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  39.55 
 
 
532 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  30.73 
 
 
601 aa  175  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  29.87 
 
 
567 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  35.76 
 
 
557 aa  171  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  34.38 
 
 
585 aa  171  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  29.25 
 
 
567 aa  170  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  30.88 
 
 
549 aa  170  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  35.99 
 
 
575 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  37.41 
 
 
546 aa  167  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  32.07 
 
 
516 aa  166  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  32.07 
 
 
516 aa  166  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  30.33 
 
 
552 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  32.92 
 
 
549 aa  164  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  37.07 
 
 
549 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  30.23 
 
 
767 aa  163  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  37.07 
 
 
549 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.98 
 
 
552 aa  161  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  32.44 
 
 
533 aa  161  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  34.98 
 
 
572 aa  160  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  31.25 
 
 
550 aa  159  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  36.54 
 
 
548 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  30.77 
 
 
558 aa  159  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0930  sulfate transporter  29.77 
 
 
489 aa  157  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  34.83 
 
 
573 aa  157  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  29.26 
 
 
606 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4401  sulfate transporter  29.51 
 
 
489 aa  156  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840656  hitchhiker  0.00000000131237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  31.22 
 
 
563 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4695  sulphate transporter  37.07 
 
 
549 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582462  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  30.54 
 
 
536 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0781  sulphate transporter  29.3 
 
 
489 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  35.25 
 
 
555 aa  155  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  33 
 
 
551 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>