More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2901 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  100 
 
 
787 aa  1563    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  55.63 
 
 
754 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  57.51 
 
 
749 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  47.93 
 
 
726 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  46.01 
 
 
769 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  46.05 
 
 
783 aa  548  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  47.74 
 
 
764 aa  545  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  46.78 
 
 
867 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  47.27 
 
 
739 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  52.05 
 
 
877 aa  456  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  42.39 
 
 
505 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  40.49 
 
 
522 aa  287  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  40.04 
 
 
508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  40.5 
 
 
510 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  40.69 
 
 
523 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  40.26 
 
 
523 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  37.4 
 
 
519 aa  277  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  41.89 
 
 
510 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  41.24 
 
 
505 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  40.82 
 
 
526 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  38.63 
 
 
522 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  40.21 
 
 
523 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  39.44 
 
 
522 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  39.87 
 
 
510 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  40.82 
 
 
510 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  38.41 
 
 
508 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  38.32 
 
 
512 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  41.04 
 
 
508 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  40.29 
 
 
485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  33.65 
 
 
531 aa  234  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  32.59 
 
 
565 aa  231  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  31.67 
 
 
534 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  27.33 
 
 
768 aa  212  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  32.2 
 
 
548 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  27.41 
 
 
768 aa  210  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  34.21 
 
 
549 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  33.01 
 
 
526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  29.62 
 
 
542 aa  201  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  32.78 
 
 
527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  33 
 
 
526 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  32.67 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  32.63 
 
 
516 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  32.63 
 
 
516 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  29.11 
 
 
756 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  32.05 
 
 
515 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.05 
 
 
515 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  32.69 
 
 
516 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  32.05 
 
 
515 aa  190  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.05 
 
 
515 aa  190  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.05 
 
 
515 aa  190  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.05 
 
 
515 aa  190  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.05 
 
 
515 aa  190  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  31.52 
 
 
549 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  33.33 
 
 
516 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  30.41 
 
 
525 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  33.33 
 
 
520 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  32.74 
 
 
547 aa  187  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  32.82 
 
 
516 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  35.31 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  30.43 
 
 
506 aa  181  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  30.29 
 
 
531 aa  181  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  32.76 
 
 
516 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  34.6 
 
 
564 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  33.61 
 
 
516 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  28.14 
 
 
553 aa  178  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  33.61 
 
 
516 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  30.62 
 
 
520 aa  178  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  28.55 
 
 
601 aa  177  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.59 
 
 
579 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  41.26 
 
 
224 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  30.77 
 
 
568 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  34.3 
 
 
553 aa  174  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  41.04 
 
 
356 aa  173  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  30.63 
 
 
506 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  31.94 
 
 
489 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  29.53 
 
 
568 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  33.65 
 
 
572 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  30.94 
 
 
570 aa  167  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  30.93 
 
 
560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  33.49 
 
 
577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  30.07 
 
 
536 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  33.66 
 
 
560 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  35.32 
 
 
573 aa  165  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  32.7 
 
 
575 aa  164  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  32.14 
 
 
555 aa  164  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  34.24 
 
 
587 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  44.83 
 
 
228 aa  163  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  34.55 
 
 
581 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  33.8 
 
 
580 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  33.26 
 
 
551 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  40.74 
 
 
267 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  40.74 
 
 
267 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  28.25 
 
 
558 aa  161  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  33.12 
 
 
533 aa  161  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  40 
 
 
242 aa  161  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.15 
 
 
532 aa  160  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  30.84 
 
 
554 aa  160  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  30.46 
 
 
568 aa  160  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  29.74 
 
 
556 aa  160  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  39.72 
 
 
236 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>