More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2282 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  88.95 
 
 
527 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  99.81 
 
 
516 aa  993    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  94.38 
 
 
516 aa  884    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.28 
 
 
515 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  95.54 
 
 
516 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  77.28 
 
 
515 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.28 
 
 
515 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  67.33 
 
 
519 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.48 
 
 
515 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  77.48 
 
 
515 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  71.1 
 
 
526 aa  698    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  95.54 
 
 
516 aa  894    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  77.09 
 
 
547 aa  746    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  100 
 
 
516 aa  995    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  72.43 
 
 
526 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.48 
 
 
515 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  77.28 
 
 
515 aa  739    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  99.81 
 
 
516 aa  993    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  62.48 
 
 
520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  63.21 
 
 
520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  46.8 
 
 
534 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  51.92 
 
 
553 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  45.75 
 
 
525 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  42.71 
 
 
548 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  46.18 
 
 
533 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  44.88 
 
 
531 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  46.73 
 
 
489 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  45.36 
 
 
549 aa  364  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  47.13 
 
 
498 aa  359  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  42.57 
 
 
506 aa  352  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  42.77 
 
 
506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  40.64 
 
 
531 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  40.48 
 
 
768 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  40.04 
 
 
768 aa  326  7e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  39.17 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  39.17 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  38.68 
 
 
517 aa  280  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  35.55 
 
 
565 aa  276  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  36 
 
 
523 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  34.23 
 
 
560 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  36.78 
 
 
510 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  34.1 
 
 
601 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  36.85 
 
 
508 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  32.58 
 
 
553 aa  230  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  36.49 
 
 
523 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  36.81 
 
 
522 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  36.66 
 
 
523 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  37.13 
 
 
505 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  36.85 
 
 
510 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  34.26 
 
 
542 aa  223  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  36.17 
 
 
510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  36.94 
 
 
510 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  36.93 
 
 
508 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  37.2 
 
 
522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  37.2 
 
 
522 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  37.4 
 
 
505 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  39.51 
 
 
532 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  38.65 
 
 
526 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  30.04 
 
 
549 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  33.57 
 
 
767 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  38.4 
 
 
512 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  29.66 
 
 
756 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  32.75 
 
 
532 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  36.92 
 
 
783 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  36.47 
 
 
769 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  32.64 
 
 
787 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  36.45 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  36.57 
 
 
877 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  35.63 
 
 
764 aa  187  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  33.4 
 
 
749 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  35.11 
 
 
726 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  34.91 
 
 
519 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  35.4 
 
 
867 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  36.98 
 
 
485 aa  167  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  29.58 
 
 
563 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  33.68 
 
 
563 aa  156  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  30.23 
 
 
552 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  31.37 
 
 
588 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.52 
 
 
570 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.2 
 
 
579 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  26.48 
 
 
552 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02853  low affinity sulfate transporter  30.16 
 
 
545 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  30.79 
 
 
590 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  30.79 
 
 
590 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  27.4 
 
 
550 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  27.88 
 
 
568 aa  144  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  29.71 
 
 
573 aa  144  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  30.73 
 
 
590 aa  144  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  30.66 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  30.66 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  30.66 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  30.66 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  26.87 
 
 
560 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  28.16 
 
 
606 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  27.48 
 
 
552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  30.51 
 
 
572 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  28.82 
 
 
551 aa  141  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  28.35 
 
 
549 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.88 
 
 
568 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  29.66 
 
 
574 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>