More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3748 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  100 
 
 
601 aa  1201    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  46.79 
 
 
560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  45.07 
 
 
565 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  44.38 
 
 
542 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  40.97 
 
 
553 aa  398  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  42.99 
 
 
532 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  37.61 
 
 
756 aa  350  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  43.09 
 
 
532 aa  349  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  33.27 
 
 
549 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  35.24 
 
 
506 aa  253  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  35.42 
 
 
506 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  34.14 
 
 
526 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  32.27 
 
 
534 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  34.14 
 
 
526 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  31.5 
 
 
767 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  33.46 
 
 
531 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  33.57 
 
 
519 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  31.8 
 
 
520 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  32.19 
 
 
548 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.33 
 
 
515 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  33.33 
 
 
515 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.33 
 
 
515 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.33 
 
 
515 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.14 
 
 
515 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.14 
 
 
515 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  33.14 
 
 
515 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  34.03 
 
 
516 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  33.71 
 
 
547 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  32.36 
 
 
520 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  34.22 
 
 
516 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  34.22 
 
 
516 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  34.39 
 
 
516 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  34.41 
 
 
516 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  33.83 
 
 
516 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  33.08 
 
 
527 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  31.12 
 
 
525 aa  210  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  33.64 
 
 
533 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  30.62 
 
 
768 aa  209  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  30.63 
 
 
768 aa  208  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  32.9 
 
 
522 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  30.62 
 
 
549 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  32 
 
 
498 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  30.87 
 
 
531 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  28.19 
 
 
783 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  33.88 
 
 
522 aa  190  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  33.77 
 
 
522 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  31.74 
 
 
510 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  30.49 
 
 
769 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  31.18 
 
 
553 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  31.55 
 
 
726 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  31.34 
 
 
508 aa  183  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  33.33 
 
 
505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  31.12 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  32.16 
 
 
526 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  31.57 
 
 
510 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  27.81 
 
 
787 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  31.46 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  31.47 
 
 
508 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  30.69 
 
 
523 aa  173  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  28.79 
 
 
489 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  30.5 
 
 
523 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  33.14 
 
 
519 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  32.63 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  32.63 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  31 
 
 
510 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  29.5 
 
 
510 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  30.84 
 
 
523 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  29.16 
 
 
505 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  30.22 
 
 
877 aa  156  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  28.41 
 
 
508 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  29.34 
 
 
764 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  29.06 
 
 
867 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  28.44 
 
 
749 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  28.1 
 
 
575 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  25.04 
 
 
570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  28.65 
 
 
558 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  24.91 
 
 
568 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  29.12 
 
 
564 aa  136  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  25.04 
 
 
550 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  27.31 
 
 
572 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  27.24 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.86 
 
 
579 aa  134  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  24.42 
 
 
568 aa  134  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  28.7 
 
 
583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  24.29 
 
 
568 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  28.79 
 
 
426 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  24.4 
 
 
563 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  29.2 
 
 
573 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  24.81 
 
 
560 aa  130  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  26.24 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  25 
 
 
587 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  23.85 
 
 
553 aa  127  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  26.74 
 
 
551 aa  127  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  26.7 
 
 
577 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  28.6 
 
 
581 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  24.62 
 
 
560 aa  123  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  24.23 
 
 
587 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03456  hypothetical protein  26.97 
 
 
562 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002556  sulfate permease family protein  26.38 
 
 
556 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790014  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  25.09 
 
 
541 aa  121  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>