More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0463 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  100 
 
 
516 aa  1010    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  100 
 
 
516 aa  1010    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  44.81 
 
 
525 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  45.06 
 
 
548 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  43.44 
 
 
534 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  43.16 
 
 
549 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  44.11 
 
 
506 aa  392  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  43.48 
 
 
531 aa  383  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  44.11 
 
 
506 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  43.2 
 
 
533 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  39.92 
 
 
768 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  40.12 
 
 
768 aa  362  6e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  43.75 
 
 
553 aa  349  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  41.19 
 
 
526 aa  349  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  40.04 
 
 
526 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  39.18 
 
 
531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  41.11 
 
 
520 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  39.44 
 
 
519 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  38.91 
 
 
520 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  40.43 
 
 
547 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  40.72 
 
 
517 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.56 
 
 
515 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.56 
 
 
515 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  39.56 
 
 
515 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  39.36 
 
 
515 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.36 
 
 
515 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.36 
 
 
515 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.36 
 
 
515 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  38.76 
 
 
527 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  40.2 
 
 
516 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  40.37 
 
 
498 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  40 
 
 
516 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  38.92 
 
 
489 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  39.13 
 
 
516 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  39.13 
 
 
516 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  39.24 
 
 
516 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  38.93 
 
 
516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  34.09 
 
 
565 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  31.29 
 
 
549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  35.69 
 
 
523 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  35.62 
 
 
523 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  34.69 
 
 
783 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  34.57 
 
 
522 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  30.39 
 
 
560 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  31.35 
 
 
542 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  35.27 
 
 
764 aa  206  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.24 
 
 
532 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  34.55 
 
 
526 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  35.12 
 
 
726 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  30.12 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  33.87 
 
 
522 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  33.87 
 
 
522 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  33.33 
 
 
769 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  32.73 
 
 
787 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  32.36 
 
 
510 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  32.19 
 
 
601 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  32.93 
 
 
877 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  33.2 
 
 
508 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  28.63 
 
 
756 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  34.39 
 
 
523 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  34.59 
 
 
508 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  28.21 
 
 
767 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  33.13 
 
 
505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  32.47 
 
 
510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  33.13 
 
 
510 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  34.97 
 
 
505 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  33.08 
 
 
512 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  31.45 
 
 
749 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  32.09 
 
 
510 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  32.79 
 
 
867 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  30.41 
 
 
532 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  31.78 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  30.46 
 
 
508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  32.32 
 
 
754 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  27.32 
 
 
552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.04 
 
 
579 aa  150  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  30.23 
 
 
583 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  30.6 
 
 
564 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  28.28 
 
 
567 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  31.76 
 
 
549 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  31.76 
 
 
549 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  26.85 
 
 
552 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  28.8 
 
 
556 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  27.67 
 
 
568 aa  143  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  31.34 
 
 
536 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  27.71 
 
 
575 aa  143  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  27.82 
 
 
567 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  29.57 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  27.22 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  27.13 
 
 
563 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  27.39 
 
 
572 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4695  sulphate transporter  31.76 
 
 
549 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582462  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  28.43 
 
 
553 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  27.88 
 
 
568 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  27.59 
 
 
568 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  28.35 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  33.68 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  27.23 
 
 
560 aa  134  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  29.27 
 
 
583 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  26.85 
 
 
570 aa  133  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>