More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1554 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  100 
 
 
526 aa  991    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  73.92 
 
 
522 aa  716    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  72.94 
 
 
522 aa  683    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  72.75 
 
 
522 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  60.53 
 
 
505 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  54.81 
 
 
508 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  56.26 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  54.55 
 
 
523 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  54.49 
 
 
523 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  52.86 
 
 
510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  54.32 
 
 
508 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  55.1 
 
 
505 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  52.75 
 
 
510 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  54.29 
 
 
510 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  53.89 
 
 
523 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  55.1 
 
 
510 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  53.47 
 
 
508 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  46.65 
 
 
519 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  42.39 
 
 
749 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  42.07 
 
 
769 aa  296  8e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  41.55 
 
 
783 aa  293  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  41.06 
 
 
726 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  41.62 
 
 
764 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  43.8 
 
 
485 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  41.24 
 
 
787 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  41.06 
 
 
877 aa  265  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  44.65 
 
 
867 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  35.71 
 
 
534 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  32.67 
 
 
565 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  40.94 
 
 
754 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  36.97 
 
 
531 aa  236  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  35.14 
 
 
549 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.34 
 
 
515 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  38.34 
 
 
515 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.34 
 
 
515 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.34 
 
 
515 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.34 
 
 
515 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  38.34 
 
 
515 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.34 
 
 
515 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  32.08 
 
 
548 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  36.89 
 
 
519 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  36.67 
 
 
526 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  37.38 
 
 
547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  34.37 
 
 
525 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  38.08 
 
 
520 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  39.21 
 
 
520 aa  220  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  37.25 
 
 
526 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  34.87 
 
 
506 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  39.4 
 
 
553 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  32.94 
 
 
768 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  32.94 
 
 
768 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  39.76 
 
 
516 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  39.76 
 
 
516 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  34.81 
 
 
506 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  39.64 
 
 
516 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  38.81 
 
 
498 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  39.76 
 
 
516 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  39 
 
 
527 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  33.14 
 
 
531 aa  203  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  39.2 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  39.76 
 
 
516 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  30.91 
 
 
756 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  33.87 
 
 
489 aa  192  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  29.49 
 
 
553 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  32.87 
 
 
601 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  32.33 
 
 
560 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  30.55 
 
 
542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  36.63 
 
 
564 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  33.95 
 
 
572 aa  176  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  37.02 
 
 
532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  33.72 
 
 
533 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  33.01 
 
 
532 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  34.56 
 
 
580 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  30.56 
 
 
568 aa  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  30.77 
 
 
517 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.71 
 
 
579 aa  169  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  33.67 
 
 
516 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  33.67 
 
 
516 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  30.04 
 
 
549 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  36.34 
 
 
573 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  27.34 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  34.09 
 
 
554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  33.5 
 
 
570 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  28.87 
 
 
556 aa  161  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  28.33 
 
 
545 aa  160  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  26.92 
 
 
568 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  34.13 
 
 
426 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  29.69 
 
 
552 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  34.52 
 
 
581 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  31.35 
 
 
563 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  32.87 
 
 
558 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  32.04 
 
 
560 aa  156  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  33.01 
 
 
575 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  34.17 
 
 
583 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  32.59 
 
 
555 aa  153  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  35.01 
 
 
577 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  28.88 
 
 
606 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  29.67 
 
 
541 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  27.27 
 
 
568 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  35.56 
 
 
581 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>