More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3570 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  100 
 
 
756 aa  1534    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  42.64 
 
 
542 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  39.89 
 
 
553 aa  382  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  39.56 
 
 
560 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  37.99 
 
 
565 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  40.45 
 
 
532 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  37.29 
 
 
549 aa  355  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  37.61 
 
 
601 aa  345  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  39.34 
 
 
532 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  27.42 
 
 
767 aa  279  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  30.75 
 
 
534 aa  233  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  31.84 
 
 
531 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  31.41 
 
 
519 aa  225  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  35.15 
 
 
506 aa  221  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  30.71 
 
 
526 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  30.3 
 
 
526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  29.94 
 
 
520 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  34.95 
 
 
506 aa  211  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  30 
 
 
548 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  30.99 
 
 
520 aa  205  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  32.71 
 
 
549 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  30.8 
 
 
768 aa  204  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  30.12 
 
 
522 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  30.64 
 
 
527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  31.12 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  31.12 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  31.12 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  31.12 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  31.12 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  31.12 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  31.12 
 
 
515 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  30.99 
 
 
768 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  30.92 
 
 
547 aa  198  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  31.38 
 
 
522 aa  197  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  31.38 
 
 
522 aa  197  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  28.57 
 
 
783 aa  197  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  28.6 
 
 
523 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  29.39 
 
 
523 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  29.6 
 
 
525 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  30.52 
 
 
508 aa  190  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  30.24 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  29.14 
 
 
516 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  29.14 
 
 
516 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  30.18 
 
 
516 aa  184  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  31 
 
 
526 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  29.1 
 
 
510 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  29.52 
 
 
516 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  29.49 
 
 
510 aa  180  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  31.33 
 
 
531 aa  180  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  29.66 
 
 
516 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  29.31 
 
 
553 aa  179  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  27.82 
 
 
769 aa  178  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  27.4 
 
 
726 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  30.39 
 
 
533 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  27.57 
 
 
787 aa  171  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  32.21 
 
 
517 aa  171  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  28.35 
 
 
505 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  29.67 
 
 
512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  29.72 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  28.46 
 
 
508 aa  164  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  27.17 
 
 
749 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  27.98 
 
 
764 aa  162  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  29.22 
 
 
505 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  29.32 
 
 
489 aa  161  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  29.71 
 
 
519 aa  160  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  29.13 
 
 
510 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  29.53 
 
 
508 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  27.5 
 
 
523 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  29.16 
 
 
564 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  30.21 
 
 
498 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  27.93 
 
 
516 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  27.93 
 
 
516 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  27.2 
 
 
563 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  29.17 
 
 
573 aa  144  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  25.78 
 
 
583 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  26.96 
 
 
877 aa  144  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  31.4 
 
 
867 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  29.2 
 
 
426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  24.71 
 
 
541 aa  141  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  25.8 
 
 
579 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  27.95 
 
 
550 aa  141  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  28.35 
 
 
581 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  26.72 
 
 
552 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  27.88 
 
 
568 aa  138  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  26.19 
 
 
560 aa  138  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  26.39 
 
 
555 aa  138  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  27.56 
 
 
587 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02331  putative sulfate transporter  27.47 
 
 
550 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.868992  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02441  putative sulfate transporter  26.46 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0624614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  26.24 
 
 
563 aa  135  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0216  putative sulfate transporter  27.23 
 
 
550 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  29.89 
 
 
581 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02351  putative sulfate transporter  26.7 
 
 
550 aa  134  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02341  putative sulfate transporter  27.25 
 
 
577 aa  134  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  27.42 
 
 
575 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  24.71 
 
 
606 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  24.07 
 
 
567 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  26.99 
 
 
568 aa  132  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  26.64 
 
 
568 aa  132  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  24.65 
 
 
560 aa  132  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>