More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03009 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1010    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  69.2 
 
 		 519 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  68.99 
 
 		 526 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  69.77 
 
 		 526 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  64.07 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  64.07 
 
 		 515 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  64.07 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  63.86 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  63.86 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  63.86 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  63.86 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  63.97 
 
 		 547 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  63.46 
 
 		 516 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  62.52 
 
 		 527 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  60.2 
 
 		 520 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  62.74 
 
 		 516 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  62.74 
 
 		 516 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  62.48 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  62.28 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  62.48 
 
 		 516 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  50.9 
 
 		 553 aa  415  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  47.97 
 
 		 531 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  46.77 
 
 		 533 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  43.13 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  42.56 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  43.78 
 
 		 525 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  44.51 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  44.72 
 
 		 498 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  40.24 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  41.86 
 
 		 549 aa  350  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  40.65 
 
 		 506 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  40.41 
 
 		 768 aa  343  5.999999999999999e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  40.15 
 
 		 531 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  40.41 
 
 		 768 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  39.46 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  39.46 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  38.57 
 
 		 517 aa  296  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  34.71 
 
 		 565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  39.36 
 
 		 523 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  38.77 
 
 		 523 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  39.41 
 
 		 523 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  38.05 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  39.29 
 
 		 505 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  32.58 
 
 		 560 aa  238  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  32.19 
 
 		 553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  36.25 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  39.34 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  32.31 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  38.75 
 
 		 510 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  36.75 
 
 		 510 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  33.08 
 
 		 542 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  39.21 
 
 		 508 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  33.03 
 
 		 601 aa  223  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  29.23 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  30.06 
 
 		 756 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  39.21 
 
 		 526 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  33.86 
 
 		 522 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  38.01 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  36.33 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  34.48 
 
 		 532 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  33.65 
 
 		 769 aa  199  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  34.25 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  34.25 
 
 		 522 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  35.16 
 
 		 508 aa  196  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  32.12 
 
 		 783 aa  193  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  35.88 
 
 		 877 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  30.98 
 
 		 767 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  34.81 
 
 		 726 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  33.2 
 
 		 749 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  39.37 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  32.35 
 
 		 764 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  35 
 
 		 867 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  28.97 
 
 		 787 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.03 
 
 		 579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  35.29 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  29.44 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  29.78 
 
 		 570 aa  150  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  28.7 
 
 		 558 aa  147  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  30.26 
 
 		 564 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  29.66 
 
 		 558 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  29.34 
 
 		 550 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  27.84 
 
 		 585 aa  143  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  30.68 
 
 		 554 aa  143  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  27.23 
 
 		 568 aa  143  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  28.22 
 
 		 563 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  29.2 
 
 		 573 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  28.28 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  27.68 
 
 		 552 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  28.2 
 
 		 546 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  26.89 
 
 		 570 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  33.56 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  28.12 
 
 		 552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  31.68 
 
 		 581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  32.72 
 
 		 567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  26.24 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  27.02 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  30.3 
 
 		 573 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  26.46 
 
 		 587 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  32.08 
 
 		 548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  27.02 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.352608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>