More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0119 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  91.22 
 
 
505 aa  850    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  77.78 
 
 
510 aa  760    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  90.71 
 
 
510 aa  834    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  77.78 
 
 
510 aa  740    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  90.12 
 
 
510 aa  851    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  79.76 
 
 
508 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  73.07 
 
 
523 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  76.95 
 
 
523 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  100 
 
 
508 aa  990    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  76.69 
 
 
523 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  56.94 
 
 
505 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  51.93 
 
 
522 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  53.8 
 
 
522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  53.8 
 
 
522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  54.29 
 
 
526 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  49.69 
 
 
508 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  53.85 
 
 
512 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  47.28 
 
 
519 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  42.66 
 
 
726 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  40.57 
 
 
769 aa  300  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  41.22 
 
 
783 aa  299  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  42.42 
 
 
749 aa  296  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  44.99 
 
 
485 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  39.02 
 
 
764 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  40 
 
 
787 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  40.86 
 
 
867 aa  266  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  40.59 
 
 
520 aa  264  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  39.49 
 
 
526 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  39.29 
 
 
526 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  36.79 
 
 
519 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
877 aa  249  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  37.24 
 
 
531 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  38.52 
 
 
520 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  37.72 
 
 
516 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  37.72 
 
 
516 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  32.77 
 
 
565 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  42.24 
 
 
754 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  34.54 
 
 
525 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  35.79 
 
 
534 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  36.27 
 
 
547 aa  233  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  37.77 
 
 
516 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  38.65 
 
 
516 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  33.47 
 
 
548 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.07 
 
 
515 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  36.07 
 
 
515 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.07 
 
 
515 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  35.87 
 
 
515 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.87 
 
 
515 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.87 
 
 
515 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.87 
 
 
515 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  37.43 
 
 
527 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  39.63 
 
 
553 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  38.08 
 
 
516 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  37.47 
 
 
516 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  34.17 
 
 
549 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  34.12 
 
 
531 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  35.88 
 
 
489 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  32.02 
 
 
768 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  34.13 
 
 
506 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  31.27 
 
 
542 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  32.09 
 
 
768 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  35.74 
 
 
533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  37.43 
 
 
498 aa  200  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  34.53 
 
 
506 aa  194  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  29.72 
 
 
756 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  36.66 
 
 
573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  35.41 
 
 
532 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  28.63 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  30.87 
 
 
549 aa  180  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  36.63 
 
 
572 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.67 
 
 
532 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  35.96 
 
 
575 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  33.61 
 
 
516 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  33.61 
 
 
516 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  29.29 
 
 
560 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  29.57 
 
 
601 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  30.49 
 
 
517 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  35.73 
 
 
581 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.38 
 
 
579 aa  171  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  34.88 
 
 
564 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.75 
 
 
577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  32.8 
 
 
555 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  30.19 
 
 
559 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  30.66 
 
 
585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  29.41 
 
 
558 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.51 
 
 
568 aa  163  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  30.65 
 
 
557 aa  163  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  28.88 
 
 
541 aa  163  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  32.85 
 
 
767 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  35.24 
 
 
581 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  26.01 
 
 
545 aa  159  9e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.48 
 
 
568 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  32.92 
 
 
583 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  36.43 
 
 
580 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  26.12 
 
 
568 aa  156  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.92 
 
 
570 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  33.18 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  27.08 
 
 
558 aa  154  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  30.4 
 
 
570 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  31.75 
 
 
426 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>