More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1042 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1042  sulfate transporter family protein  100 
 
 
517 aa  1017    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.106304  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  47.23 
 
 
534 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  44.71 
 
 
548 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  44.6 
 
 
525 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  46.51 
 
 
531 aa  405  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  45.78 
 
 
533 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  43.71 
 
 
549 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  43.76 
 
 
506 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  43.56 
 
 
506 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  40.83 
 
 
531 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  38.37 
 
 
520 aa  345  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  39.05 
 
 
519 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  39.88 
 
 
768 aa  342  8e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1425  sulfate transporter family protein  40.16 
 
 
515 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1287  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.16 
 
 
515 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  39.4 
 
 
526 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1051  sulfate transporter, putative  40.48 
 
 
547 aa  339  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1280  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.96 
 
 
515 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  40.28 
 
 
768 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0402  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.76 
 
 
515 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0747  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.76 
 
 
515 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1840  sulfate transporter, putative  39.76 
 
 
515 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1119  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.76 
 
 
515 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  38.74 
 
 
526 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  40.29 
 
 
516 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  40.29 
 
 
516 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  38.29 
 
 
527 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  36.73 
 
 
520 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  38.81 
 
 
516 aa  316  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  38.18 
 
 
553 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  38.88 
 
 
516 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  38.88 
 
 
516 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  39.2 
 
 
516 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  39.2 
 
 
516 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  38.68 
 
 
516 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  37.58 
 
 
489 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  37.1 
 
 
498 aa  273  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  35.78 
 
 
565 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  32.75 
 
 
522 aa  240  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  32.8 
 
 
756 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  32.95 
 
 
522 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  32.22 
 
 
560 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  32.56 
 
 
522 aa  220  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  31.71 
 
 
601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  31.04 
 
 
523 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  30.43 
 
 
523 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  30.91 
 
 
510 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.92 
 
 
532 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  30.89 
 
 
505 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  31.45 
 
 
553 aa  206  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  31.24 
 
 
510 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  31.24 
 
 
508 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  31.92 
 
 
526 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  33.2 
 
 
542 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  32.67 
 
 
508 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  32.17 
 
 
523 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  30.46 
 
 
505 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  32.63 
 
 
532 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  28.72 
 
 
783 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  29.59 
 
 
549 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  30.46 
 
 
510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  31.07 
 
 
764 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  30.08 
 
 
510 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  30 
 
 
769 aa  183  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  30.06 
 
 
508 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  28.82 
 
 
767 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  30.65 
 
 
512 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  35.02 
 
 
519 aa  177  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  29.94 
 
 
485 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  29.49 
 
 
726 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  29.88 
 
 
570 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  30.68 
 
 
550 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  26.35 
 
 
787 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  26.06 
 
 
570 aa  153  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  27.4 
 
 
749 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  30.93 
 
 
552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  27.61 
 
 
545 aa  148  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  28.01 
 
 
568 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  29.27 
 
 
553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  29.56 
 
 
559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  24.38 
 
 
568 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  27.03 
 
 
552 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  29.44 
 
 
867 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  27.17 
 
 
560 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.24 
 
 
568 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  28.71 
 
 
552 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  27.93 
 
 
877 aa  143  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  25.71 
 
 
568 aa  143  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  29.07 
 
 
556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  24.75 
 
 
563 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  26.8 
 
 
567 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  26.94 
 
 
567 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  28.61 
 
 
587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  26.26 
 
 
606 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  27.5 
 
 
573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  25.92 
 
 
563 aa  133  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  27.85 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  26.21 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  26.27 
 
 
575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  29.18 
 
 
551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>