89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4055 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4055  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4045  RecA/RadA recombinase-like  33.57 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  34.43 
 
 		 349 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  35.71 
 
 		 347 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  30 
 
 		 356 aa  48.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  32.5 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  33.06 
 
 		 389 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  31.15 
 
 		 418 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  30 
 
 		 339 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  34.35 
 
 		 368 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  30.58 
 
 		 379 aa  45.4  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  32.79 
 
 		 366 aa  45.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  33.08 
 
 		 379 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  34.29 
 
 		 354 aa  45.1  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  33.85 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  32 
 
 		 344 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  28.93 
 
 		 349 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  31.71 
 
 		 345 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  27.46 
 
 		 349 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  32.56 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  31.36 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  33.86 
 
 		 348 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  27.13 
 
 		 356 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  31.85 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  32.77 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0296  recA protein  28.36 
 
 		 339 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  31.15 
 
 		 353 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  31.36 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  30.33 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  30.33 
 
 		 355 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  34.96 
 
 		 379 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  30.33 
 
 		 355 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  31.54 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  29.23 
 
 		 729 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  30.77 
 
 		 355 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  30.33 
 
 		 355 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  30.33 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  30.33 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  33.85 
 
 		 374 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1062  recombinase A  30.33 
 
 		 354 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  32.31 
 
 		 345 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  30.33 
 
 		 355 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  34.75 
 
 		 357 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  34.43 
 
 		 384 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  29.51 
 
 		 357 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  29.51 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  31.4 
 
 		 344 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  31.36 
 
 		 347 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  29.51 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  32.59 
 
 		 352 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1195  recombinase A  30.33 
 
 		 355 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1300  recombinase A  30.33 
 
 		 353 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151962 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  31.01 
 
 		 365 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  31.15 
 
 		 361 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  33.33 
 
 		 357 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  32.54 
 
 		 367 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  31.01 
 
 		 365 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  29.06 
 
 		 348 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  32.2 
 
 		 383 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0425  recA protein  31.97 
 
 		 348 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0206  recA protein  28.69 
 
 		 350 aa  42.4  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.613588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  33.05 
 
 		 355 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1126  recombinase A  29.51 
 
 		 357 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  31.01 
 
 		 365 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  30 
 
 		 359 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  30.33 
 
 		 354 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  32.79 
 
 		 345 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  32.79 
 
 		 345 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  31.15 
 
 		 362 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  33.08 
 
 		 376 aa  42  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  29.51 
 
 		 348 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0938  recombinase A  28.75 
 
 		 356 aa  42  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126109  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  29.51 
 
 		 348 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  29.1 
 
 		 369 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2973  recA protein  29.51 
 
 		 375 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.480691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  29.41 
 
 		 343 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  30.3 
 
 		 356 aa  42  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  33.33 
 
 		 348 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  30.3 
 
 		 345 aa  41.6  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  30.08 
 
 		 349 aa  41.6  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  30.23 
 
 		 377 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  30.23 
 
 		 377 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  31.01 
 
 		 370 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  31.01 
 
 		 360 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  33.61 
 
 		 377 aa  41.6  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  29.93 
 
 		 378 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  27.2 
 
 		 364 aa  41.2  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  31.09 
 
 		 347 aa  41.6  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  29.51 
 
 		 353 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>