More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3175 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3175  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 392 aa  800    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  33.5 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  36.25 
 
 		 417 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  37.89 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  34.31 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  36.48 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  33.5 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  33.87 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  36.62 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  36.25 
 
 		 430 aa  199  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  33.68 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  33.42 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  30.95 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 410 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  35.56 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.44 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  31.95 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  37.85 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.57 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  37.29 
 
 		 466 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  32.46 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3247  DNA-directed DNA polymerase  34.57 
 
 		 459 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  37.57 
 
 		 420 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  37.33 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  32.39 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 		 444 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  33.24 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  35 
 
 		 358 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  34.34 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  36.44 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  33.76 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  37.05 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  36.07 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  35.88 
 
 		 419 aa  189  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  32.55 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  31.28 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  34.5 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  36.55 
 
 		 375 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  32.13 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  33.5 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  34.3 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  34.72 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  33.95 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.8 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  33.7 
 
 		 360 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  35.19 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  32.38 
 
 		 432 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  31.87 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  32.64 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 		 424 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  37.15 
 
 		 463 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  35.2 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  32.72 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  34.29 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  31.3 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  32.11 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  34.11 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  36.8 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  32.18 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.57 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.42 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  34.99 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  34.53 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  35.17 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  31.85 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  34.71 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  34.8 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  35.21 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  31.71 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  34.46 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  33.92 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  31.11 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  35.57 
 
 		 353 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  35.16 
 
 		 354 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  35.59 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  34.01 
 
 		 378 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  31.22 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  35.04 
 
 		 834 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  32.41 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  33.42 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.34 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  34.64 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  33.33 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  34.46 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 371 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  29.95 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  30.53 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  36.49 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  34.11 
 
 		 378 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  34.11 
 
 		 378 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 		 481 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  35.45 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  35.45 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>