195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2674 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2674  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  490  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.212259  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  45.95 
 
 
349 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  53.33 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  51.61 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  30.6 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  47.69 
 
 
348 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  47.69 
 
 
135 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  51.79 
 
 
330 aa  55.1  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  53.85 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  39 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  51.79 
 
 
325 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  55.32 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  52.94 
 
 
323 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  41.18 
 
 
362 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  51.72 
 
 
323 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  49.02 
 
 
353 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  54.9 
 
 
129 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  37 
 
 
142 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  64.44 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 
158 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  38.57 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 
154 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
148 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  43.1 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 
154 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  40.91 
 
 
114 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  38.57 
 
 
169 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 
142 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  48.28 
 
 
133 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  37.14 
 
 
171 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 
159 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  45.45 
 
 
132 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  44.78 
 
 
115 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 
159 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  44.44 
 
 
331 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  46.77 
 
 
121 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  47.69 
 
 
173 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
154 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 
146 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  40.62 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.44 
 
 
145 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  40.35 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  46.55 
 
 
133 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  38.71 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  40 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  43.28 
 
 
301 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  40.26 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  42.47 
 
 
153 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  34.25 
 
 
155 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  65.52 
 
 
178 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.02 
 
 
167 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  64.71 
 
 
148 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
139 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 
144 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  45.16 
 
 
118 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
157 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 
159 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  41.38 
 
 
161 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36.17 
 
 
171 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  44.62 
 
 
173 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  40.35 
 
 
140 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  47.06 
 
 
139 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 
144 aa  45.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  48.21 
 
 
152 aa  45.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
144 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.08 
 
 
157 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 
150 aa  45.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  44.26 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  38.18 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 
146 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  44.16 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0879  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  37.14 
 
 
141 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  47.46 
 
 
118 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  36.99 
 
 
377 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  47.17 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>