More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0855 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0855  RNA methyltransferase  100 
 
 		 493 aa  998    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  51.77 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  43.09 
 
 		 378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00141  tRNA methyltransferase (Eurofung)  35.06 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51919  tRNA(m5U54)methyltransferase  33.07 
 
 		 560 aa  264  3e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00837808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03280  tRNA methyltransferase, putative  36.88 
 
 		 613 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.73 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32.98 
 
 		 436 aa  206  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  27.71 
 
 		 460 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  29.74 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  29.76 
 
 		 460 aa  200  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  32.57 
 
 		 466 aa  200  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  31.85 
 
 		 439 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  30.17 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  30.34 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  30.52 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  30.28 
 
 		 419 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  30.17 
 
 		 454 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  30.34 
 
 		 454 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  29.74 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  29.5 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  31.16 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  28.71 
 
 		 461 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  28.71 
 
 		 461 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  31.01 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.57 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  30.47 
 
 		 459 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50774  RNA methyltransferase tRNA(m5U54)methyltransferase  28.94 
 
 		 542 aa  189  9e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.2179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  28.83 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  29.57 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  29.76 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  32.86 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.07 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  29.98 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  30.16 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  29.01 
 
 		 467 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.22 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  29.93 
 
 		 460 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  30.71 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  28.02 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  28.67 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  28.83 
 
 		 455 aa  177  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  30.93 
 
 		 488 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  28.46 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  28.82 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  28.82 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  27.68 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  28.08 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  26.86 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  26.71 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  28.79 
 
 		 471 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  29.72 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  30.2 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  26.79 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.21 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  29.49 
 
 		 482 aa  170  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  29.84 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  26.67 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  26.07 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.76 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  26.76 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  27.98 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.47 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  33.4 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  28.94 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  29.55 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  30.43 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  25.65 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  32.64 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 489 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  28.21 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  29.25 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.03 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  27.62 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  27.41 
 
 		 465 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_002936  DET1065  RNA methyltransferase  27.47 
 
 		 395 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.929187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.87 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  25.49 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  27.6 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  29.4 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1412  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.68 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  27.8 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  25.82 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  27.17 
 
 		 400 aa  150  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.41 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  30.99 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02120  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.77 
 
 		 543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.9 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.6 
 
 		 463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  22.32 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.81 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  28.25 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  28.83 
 
 		 536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>