More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51919 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_51919  tRNA(m5U54)methyltransferase  100 
 
 		 560 aa  1151    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00837808  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00141  tRNA methyltransferase (Eurofung)  38.62 
 
 		 575 aa  347  4e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03280  tRNA methyltransferase, putative  36.22 
 
 		 613 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  35.19 
 
 		 407 aa  266  8.999999999999999e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50774  RNA methyltransferase tRNA(m5U54)methyltransferase  33.03 
 
 		 542 aa  261  2e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.2179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0855  RNA methyltransferase  33.07 
 
 		 493 aa  254  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  33.18 
 
 		 378 aa  228  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  28.02 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  27.89 
 
 		 467 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.59 
 
 		 459 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  27.7 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  27.03 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  26.99 
 
 		 470 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  27.38 
 
 		 459 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  27.38 
 
 		 459 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  29.11 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  27.38 
 
 		 459 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  27.18 
 
 		 459 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  27.18 
 
 		 459 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.18 
 
 		 459 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.18 
 
 		 459 aa  154  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  27.09 
 
 		 459 aa  153  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  29.05 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  26.99 
 
 		 439 aa  150  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  26.99 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  27.27 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  26.73 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  27.21 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  26.15 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.82 
 
 		 455 aa  147  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  26.73 
 
 		 468 aa  146  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  25.16 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  27.13 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  25.1 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  27.13 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  24.85 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  26 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  26.24 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  25.74 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  25.3 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  26.43 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  27.57 
 
 		 448 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  27.03 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  25.56 
 
 		 441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  27.06 
 
 		 463 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  27.35 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  26.22 
 
 		 473 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.74 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  27.33 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  25.99 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  27.69 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  25.98 
 
 		 572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  28.09 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  28.09 
 
 		 454 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  25.93 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  24.6 
 
 		 465 aa  134  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  25.47 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  23.93 
 
 		 488 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  28.06 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  25.62 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  24.72 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  26.78 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  27.14 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  27.31 
 
 		 453 aa  130  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  28.29 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  23.66 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  23.74 
 
 		 465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  25.66 
 
 		 446 aa  128  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  25.99 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  27 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  26.73 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  25.16 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  28.37 
 
 		 459 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  26.34 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  29.1 
 
 		 452 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  24.8 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  24.46 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  24.8 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  25.37 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  26.73 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  26.52 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  35.23 
 
 		 439 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  25.76 
 
 		 476 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  25.11 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  23.5 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  26.33 
 
 		 438 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  25.66 
 
 		 489 aa  124  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  25.43 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  24.74 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  24.44 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0352  RNA methyltransferase  34.72 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  25.66 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.43 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  32.84 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  26.03 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  25.64 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  23.76 
 
 		 465 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.89 
 
 		 452 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.94 
 
 		 456 aa  120  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>