More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2790 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
326 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3725  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.03 
 
 
321 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.45 
 
 
320 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.25 
 
 
316 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454813  normal  0.0322224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.25 
 
 
303 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0426615  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.91 
 
 
303 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0838187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1046  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.03 
 
 
311 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.852224  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.95 
 
 
312 aa  347  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43509  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.72 
 
 
307 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1732  ABC transporter, permease protein  58.5 
 
 
313 aa  342  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000109023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2047  ABC transporter, permease protein  58.5 
 
 
313 aa  342  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000569002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1621  ABC transporter, permease protein  58.5 
 
 
313 aa  342  7e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01399  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  58.17 
 
 
313 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.69 
 
 
308 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344499 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.17 
 
 
313 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1526  ABC transporter, permease protein  58.17 
 
 
313 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01410  hypothetical protein  58.17 
 
 
313 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.84 
 
 
313 aa  339  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.91 
 
 
303 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179678  normal  0.456991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.17 
 
 
314 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.88 
 
 
307 aa  335  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.04 
 
 
310 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.05 
 
 
312 aa  292  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
282 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.34501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1542  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.5 
 
 
281 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1802  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 
291 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
281 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716489  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270331  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
295 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
669 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6837  putrescine ABC transporter membrane protein  34.91 
 
 
304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
287 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.4 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1599  spermidine/putrescine transport system permease protein  29.86 
 
 
293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120621  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
303 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00131035  hitchhiker  0.000000775198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
331 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
328 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
328 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
303 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
331 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
328 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
293 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
278 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.14 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1647  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.53 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.16764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.16 
 
 
319 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.59 
 
 
286 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
269 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000222411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.14 
 
 
328 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  30.95 
 
 
324 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1960  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.4 
 
 
324 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
293 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
304 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.19128  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
328 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2038  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  29.84 
 
 
292 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.478202  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.73 
 
 
297 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.31 
 
 
330 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
302 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
324 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  28.73 
 
 
286 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
305 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
294 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
304 aa  123  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
290 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
265 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00769125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
265 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000544775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
293 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
323 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
305 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.987199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
362 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  30.93 
 
 
326 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1581  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.62 
 
 
285 aa  122  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.59 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1694  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.52 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  30.93 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  30.1 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  30.1 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
301 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
323 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.28 
 
 
286 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
277 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.069408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.45 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
299 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
282 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
301 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
285 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
309 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  37.22 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167031  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>