More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3853 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
326 aa  640    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
295 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
275 aa  178  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00131219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
302 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1599  spermidine/putrescine transport system permease protein  38.41 
 
 
293 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120621  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
269 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
293 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  37.97 
 
 
309 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.21 
 
 
278 aa  175  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
287 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0521412  hitchhiker  0.0000000382912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2301  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.86 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716489  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
289 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00460973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
287 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3928  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  42.33 
 
 
305 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0326489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  38.66 
 
 
297 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
306 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
275 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00480798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
302 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
287 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  42.52 
 
 
297 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  34.75 
 
 
281 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
281 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
305 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 
328 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
331 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.09 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  34.36 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2038  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  40.19 
 
 
292 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.478202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  43.22 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
331 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.631485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.81 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879791  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
295 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1262  ABC-type spermidine/putrescine transport system  41.45 
 
 
322 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378424  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1802  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  36.26 
 
 
326 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  36.26 
 
 
326 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
301 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
301 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
301 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
305 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
301 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.994225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  35.84 
 
 
324 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1542  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.52 
 
 
281 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0288  ABC transporter permease  36.36 
 
 
306 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 
326 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
324 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
301 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  35.9 
 
 
326 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.11 
 
 
330 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
301 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
301 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
301 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
328 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
297 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3143  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42 
 
 
305 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138017  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
299 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
313 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2399  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
297 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
296 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0764825  normal  0.0907135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
301 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.55 
 
 
303 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00131035  hitchhiker  0.000000775198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
297 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  38.86 
 
 
309 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
301 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
306 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.995007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
316 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454813  normal  0.0322224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
305 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167031  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
305 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1952  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
309 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00258406  normal  0.610972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
309 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
303 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
303 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
323 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.43 
 
 
286 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.83 
 
 
286 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  35.43 
 
 
286 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.97 
 
 
331 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203836  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
301 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
309 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3671  polyamine ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
292 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
669 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
309 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.97 
 
 
334 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0706374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>