More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2970 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
301 aa  603  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.994225 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.73 
 
 
278 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.02 
 
 
301 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61 
 
 
295 aa  319  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.6 
 
 
294 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.46 
 
 
289 aa  291  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.518454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0347  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.2 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00626378  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.123656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  36.11 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.47 
 
 
282 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.47 
 
 
282 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
282 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
282 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
299 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2038  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  35.79 
 
 
292 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.478202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  35.32 
 
 
281 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1178  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  34.47 
 
 
282 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1376  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
282 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
282 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1180  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  34.47 
 
 
282 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00976508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2400  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.45 
 
 
318 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272456  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  37.26 
 
 
309 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1399  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
282 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
326 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
317 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
282 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
301 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  33.6 
 
 
326 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3671  polyamine ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 
292 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1861  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.96 
 
 
286 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  33.6 
 
 
326 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2146  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.96 
 
 
286 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2666  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  35.42 
 
 
284 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.63 
 
 
314 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
295 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
305 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
287 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  33.46 
 
 
326 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0288  ABC transporter permease  34.31 
 
 
306 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  36.84 
 
 
284 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
328 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
326 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
293 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3143  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.14 
 
 
305 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138017  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.67 
 
 
328 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
328 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
328 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
328 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.41 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2141  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1959  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1304  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.97 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1342  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.377668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
305 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
328 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
281 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
324 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1326  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.97 
 
 
287 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0226525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
331 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.51 
 
 
319 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
331 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
289 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1566  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.6 
 
 
287 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
285 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1303  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.97 
 
 
287 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
323 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  33.07 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
309 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01123  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.84 
 
 
275 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
285 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000172169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1245  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.84 
 
 
285 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.332009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01131  hypothetical protein  32.84 
 
 
275 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
323 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.46 
 
 
319 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
287 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
304 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119366  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2478  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.84 
 
 
285 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165165  normal  0.578338 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.83 
 
 
286 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
305 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167031  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2001  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.84 
 
 
285 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.24 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
305 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1952  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00258406  normal  0.610972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0749  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  33.11 
 
 
304 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111773  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1638  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.16 
 
 
285 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
305 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0157506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
296 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>