More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0229 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0229  DnaB domain-containing protein  100 
 
 
500 aa  1037    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.594678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  29.98 
 
 
496 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  29.96 
 
 
500 aa  189  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  29.8 
 
 
501 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  29.4 
 
 
498 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  30.85 
 
 
502 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  29.8 
 
 
501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  30.25 
 
 
499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  30.14 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  29.94 
 
 
498 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  29.4 
 
 
501 aa  180  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  30.93 
 
 
498 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  29.96 
 
 
498 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  30.38 
 
 
498 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  30.1 
 
 
498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  29.07 
 
 
496 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  28.48 
 
 
493 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  29.28 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  27.94 
 
 
498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  28.57 
 
 
497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  28.63 
 
 
496 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  28.6 
 
 
497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  29.46 
 
 
496 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  29.25 
 
 
496 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  29.21 
 
 
499 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  28.42 
 
 
506 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  27.92 
 
 
495 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  27.92 
 
 
495 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  28.43 
 
 
493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  26.79 
 
 
505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  28.27 
 
 
495 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  28.27 
 
 
495 aa  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  28.27 
 
 
495 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  28.48 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  27.46 
 
 
501 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  27.18 
 
 
503 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  27.38 
 
 
494 aa  133  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  26.83 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  26.25 
 
 
494 aa  131  4.0000000000000003e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  26.24 
 
 
507 aa  130  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  27.54 
 
 
494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  24.95 
 
 
504 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  26.11 
 
 
504 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  25.65 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  28.27 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  25.93 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  27.79 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2709  DnaB domain protein helicase domain protein  26.84 
 
 
472 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  27.92 
 
 
471 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  25.22 
 
 
488 aa  115  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  28.22 
 
 
461 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  24.24 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1204  DnaB-like helicase-like  26.9 
 
 
481 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00411863  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  25.22 
 
 
488 aa  113  8.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  28.71 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  25.93 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  28.22 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3893  phage DNA helicase, putative  28.78 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  27.86 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  25.68 
 
 
446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  25.96 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  25.96 
 
 
444 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  27.85 
 
 
462 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  26 
 
 
460 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  27.49 
 
 
472 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  26.95 
 
 
472 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
460 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  27.97 
 
 
479 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  26.95 
 
 
472 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  25.29 
 
 
460 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  27.62 
 
 
460 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  28.33 
 
 
447 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0931  replicative DNA helicase  29.13 
 
 
470 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000071326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  27.74 
 
 
460 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  27.8 
 
 
460 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  27.74 
 
 
460 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  27.74 
 
 
460 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  27.74 
 
 
460 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  25.72 
 
 
481 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  25.77 
 
 
460 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  28.47 
 
 
462 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  25 
 
 
460 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  25.77 
 
 
460 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  25.78 
 
 
445 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  28.47 
 
 
462 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  26.51 
 
 
437 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3747  replicative DNA helicase  26.71 
 
 
453 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  27.05 
 
 
472 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  27.98 
 
 
473 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  26.21 
 
 
446 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  23.81 
 
 
454 aa  103  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  26.09 
 
 
470 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>