More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1204 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1204  DnaB-like helicase-like  100 
 
 
481 aa  994    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00411863  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  30.53 
 
 
498 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  30.74 
 
 
498 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  30.69 
 
 
499 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  30.43 
 
 
498 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  31.96 
 
 
502 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  30.82 
 
 
496 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  30.12 
 
 
501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  31.3 
 
 
498 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  30.31 
 
 
498 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  29.1 
 
 
501 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  30.45 
 
 
495 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  28.89 
 
 
501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  31.11 
 
 
498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  31.52 
 
 
498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  30.75 
 
 
495 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  31.35 
 
 
496 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  30.93 
 
 
496 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  29.9 
 
 
498 aa  177  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  30.43 
 
 
495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  27.81 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  30.71 
 
 
495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  30.71 
 
 
495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  28.6 
 
 
497 aa  172  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  30.24 
 
 
495 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  28.72 
 
 
493 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  28.36 
 
 
497 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  28.06 
 
 
506 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  26.88 
 
 
504 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  29.38 
 
 
494 aa  149  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  26.61 
 
 
504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  27.69 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  27.69 
 
 
496 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  27.69 
 
 
496 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  26.67 
 
 
505 aa  146  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3562  DnaB domain protein helicase domain protein  31.05 
 
 
479 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  26.99 
 
 
499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  25.57 
 
 
501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  24.7 
 
 
507 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  24.84 
 
 
503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  29.47 
 
 
441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  26.95 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  26.87 
 
 
493 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  24.01 
 
 
504 aa  127  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  24.33 
 
 
441 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  25.28 
 
 
448 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  24.38 
 
 
483 aa  123  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  24.57 
 
 
456 aa  123  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  25.45 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  23.93 
 
 
456 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  25.66 
 
 
444 aa  120  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  24.02 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  25.85 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  24.4 
 
 
464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  25.05 
 
 
454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  24.2 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  25.6 
 
 
449 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  23.82 
 
 
462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  23.82 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  24.25 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  23.66 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  24.04 
 
 
460 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  24.68 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  24.68 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  24.55 
 
 
446 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0229  DnaB domain-containing protein  26.9 
 
 
500 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.594678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  24.34 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  25.12 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4095  DnaB domain-containing protein  27.25 
 
 
482 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  25.49 
 
 
469 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  23.35 
 
 
488 aa  111  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  23.06 
 
 
462 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3747  replicative DNA helicase  25.54 
 
 
453 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  23.83 
 
 
473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  25.05 
 
 
446 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  23.39 
 
 
488 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  24.12 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  23.16 
 
 
460 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3371  DnaB family helicase  26.44 
 
 
455 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  27.08 
 
 
449 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1873  DnaB domain-containing protein  26.22 
 
 
465 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  22.7 
 
 
463 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  23.57 
 
 
460 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  22.94 
 
 
460 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0026  replicative DNA helicase  24.88 
 
 
470 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  25.94 
 
 
446 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  23.19 
 
 
460 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  22.4 
 
 
472 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  24.15 
 
 
479 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  22.48 
 
 
463 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  26.35 
 
 
437 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  25.25 
 
 
476 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  24.21 
 
 
453 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  22.57 
 
 
466 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  24.51 
 
 
468 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  22.98 
 
 
460 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  22.5 
 
 
462 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  23.1 
 
 
460 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  23.1 
 
 
460 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6988  DnaB domain protein helicase domain protein  26.54 
 
 
487 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>